RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390009.7

ACTN4-202, Transcript of actinin alpha 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTN4, Length 2,102 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4-202ENST00000390009 A0A1W2PPV4 95 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTN4-202ENST00000390009 NDUFS7O75251 213 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTN4-202ENST00000390009 CHRNA7P36544 502 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTN4-202ENST00000390009 PSMB3P49720 205 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTN4-202ENST00000390009 ARF6P62330 175 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTN4-202ENST00000390009 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTN4-202ENST00000390009 RAB31Q13636 194 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTN4-202ENST00000390009 RPEQ96AT9 228 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTN4-202ENST00000390009 MANBALQ9NQG1 85 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTN4-202ENST00000390009 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTN4-202ENST00000390009 NAV3Q8IVL0 2385 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTN4-202ENST00000390009 LOC105371242A0A075B767 164 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTN4-202ENST00000390009 IGFBP2P18065 325 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTN4-202ENST00000390009 CD81P60033 236 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTN4-202ENST00000390009 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTN4-202ENST00000390009 SLC35E3Q7Z769 313 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTN4-202ENST00000390009 FAM122AQ96E09 287 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTN4-202ENST00000390009 TACC2O95359 2948 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN4-202ENST00000390009 A6NNC1 897 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN4-202ENST00000390009 COLCA2A8K830 154 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN4-202ENST00000390009 PAX6P26367 422 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN4-202ENST00000390009 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ACTN4-202ENST00000390009 WT1-ASQ06250 92 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN4-202ENST00000390009 STPG3Q8N7X2 389 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN4-202ENST00000390009 C15orf54Q8N8G6 183 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN4-202ENST00000390009 TEX45Q8NA69 505 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN4-202ENST00000390009 GATAD1Q8WUU5 269 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN4-202ENST00000390009 TVP23CQ96ET8 276 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN4-202ENST00000390009 TUBA4BQ9H853 241 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN4-202ENST00000390009 SIRT7Q9NRC8 400 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN4-202ENST00000390009 LY6LH3BQJ8 138 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN4-202ENST00000390009 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ACTN4-202ENST00000390009 RPL29P47914 159 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ACTN4-202ENST00000390009 TMEM144Q7Z5S9 345 aa14.65□□□□□ -0.06
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ACTN4-202ENST00000390009 CD69Q07108 199 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 MLANAQ16655 118 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 TMEM249Q2WGJ8 235 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 PRR20EP86478 221 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 PRR20CP86479 221 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 PRR20DP86480 221 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 PRR20BP86481 221 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 PRR20AP86496 221 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 OR11H6Q8NGC7 330 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 ACACBO00763 2458 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 A0A1W2PPI3 338 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 PAGE4O60829 102 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 CRYGBP07316 175 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 FOLR2P14207 255 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 PSG5Q15238 335 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 PRSS8Q16651 343 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 MMD2Q8IY49 270 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 STAG3L2P0CL84 134 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 STAG3L3P0CL85 134 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 EFNA4P52798 201 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 RAB5BP61020 215 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 ABHD5Q8WTS1 349 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 CACNG8Q8WXS5 425 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 SLC45A2Q9UMX9 530 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 SIGLEC9Q9Y336 463 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 ARL14EPLP0DKL9 152 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 HTR1DP28221 377 aa14.61□□□□□ -0.07
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ACTN4-202ENST00000390009 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 SLC16A13Q7RTY0 426 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 LURAP1LQ8IV03 231 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 OR4F5Q8NH21 305 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 HIST1H2BAQ96A08 127 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 OR4F4Q96R69 305 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 ZNF727A8MUV8 499 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 TMEM250H0YL14 139 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 ACTL6BO94805 426 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 LINC00869P0C866 280 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 PRTN3P24158 256 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.073e-6■□□□□ 8.1
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ACTN4-202ENST00000390009 TNXAQ16473 311 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 NANPQ8TBE9 248 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 CFAP46Q8IYW2 2715 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 IGSF10Q6WRI0 2623 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 A0A087WWC5 75 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 SMIM6P0DI80 62 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 OR10J1P30954 320 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 RHOBP62745 196 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 SPNS3Q6ZMD2 512 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 SLC35E1Q96K37 410 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 DPM3Q9P2X0 92 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 AKAP6Q13023 2319 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN4-202ENST00000390009 IGLC7A0M8Q6 106 aa14.59□□□□□ -0.07
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