RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 ERHP84090 104 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF616Q08AN1 781 aa12.25□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 TREML4Q6UXN2 200 aa12.25□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 NPBQ8NG41 125 aa12.25□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 PARP11Q9NR21 331 aa12.25□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 CSPG4Q6UVK1 2322 aa12.25□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 TRAV40A0A0B4J280 105 aa12.24□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa12.24□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 I3L521 148 aa12.24□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP12.24□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 ACTL6BO94805 426 aa12.24□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 IGHV1-69P01742 117 aa12.24□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 AREGP15514 252 aa12.24□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 C2orf83Q53S99 150 aa12.24□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 Q5PR19 223 aa12.24□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 MARC2Q969Z3 335 aa12.24□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1W2PN81 502 aa12.23□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 IGLC7A0M8Q6 106 aa12.23□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 CHRNA7P36544 502 aa12.23□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 AKR1C1Q04828 323 aa12.23□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 EBI3Q14213 229 aa12.23□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 Q8N6K4 173 aa12.23□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 P2RX4Q99571 388 aa12.23□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 NPCDR1Q9BY65 106 aa12.23□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 INS-IGF2F8WCM5 200 aa12.23□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 NDUFA3O95167 84 aa12.23□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM11P17152 192 aa12.23□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 MAS1LP35410 378 aa12.23□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 RAB5CP51148 216 aa12.23□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 ELLP55199 621 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa12.23□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 ACSM6Q6P461 480 aa12.23□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa12.23□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 LINC01356Q8N9X3 169 aa12.23□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 RPRMQ9NS64 109 aa12.23□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 WDR83OSQ9Y284 106 aa12.23□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 TEX22C9J3V5 150 aa12.22□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 TRIM77I1YAP6 450 aa12.22□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 CNIH1O95406 144 aa12.22□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 IGHV3-48P01763 117 aa12.22□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 CCL20P78556 96 aa12.22□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 DLK1P80370 383 aa12.22□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 C5orf64Q2M2E5 130 aa12.22□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa12.22□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 LYPD6BQ8NI32 183 aa12.22□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 KIAA1456Q9P272 454 aa12.22□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 PDZD2O15018 2839 aa12.21□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 TEX15Q9BXT5 2789 aa12.21□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 A0A0U1RQK1 487 aa12.21□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 UMAD1C9J7I0 102 aa12.21□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 TGFAP01135 160 aa12.21□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 MFAP2P55001 183 aa12.21□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 SSX7Q7RTT5 188 aa12.21□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 OR2T6Q8NHC8 308 aa12.21□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 SSMEM1Q8WWF3 244 aa12.21□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 Q96MF0 132 aa12.21□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 GGACTQ9BVM4 153 aa12.21□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM231Q9H6L2 316 aa12.21□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 NPVFQ9HCQ7 196 aa12.21□□□□□ -0.45
CASQ1-201ENST00000368078 ITPR2Q14571 2701 aa12.21□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 FAM106CPP0CH98 169 aa12.21□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 RAB2AP61019 212 aa12.21□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 SERF2P84101 59 aa12.21□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 GAMTQ14353 236 aa12.21□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF726P1Q15940 193 aa12.21□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 TOR2AQ5JU69 321 aa12.21□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 LINC00052Q96N35 136 aa12.21□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 MGST2Q99735 147 aa12.21□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 TRAV20A0A0B4J274 112 aa12.2□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 TSPAN15O95858 294 aa12.2□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 BRS3P32247 399 aa12.2□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 FXYD3Q14802 87 aa12.2□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 SPSB3Q6PJ21 355 aa12.2□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 FAM96BQ9Y3D0 163 aa12.2□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 TIMM9Q9Y5J7 89 aa12.2□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 DEFA4P12838 97 aa12.19□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 CD69Q07108 199 aa12.19□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 FFAR4Q5NUL3 377 aa12.19□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF709Q8N972 641 aa12.19□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 BPIFCQ8NFQ6 507 aa12.19□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 SFT2D1Q8WV19 159 aa12.19□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa12.19□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa12.19□□□□□ -0.46
CASQ1-201ENST00000368078 RAB19A4D1S5 217 aa12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms