RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344079.9

LRRC27-201, Transcript of leucine rich repeat containing 27, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene LRRC27, Length 1,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27-201ENST00000344079 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 C1orf159Q96HA4 380 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 ABCA12Q86UK0 2595 aa14.7□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 IGLC7A0M8Q6 106 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 FCN1O00602 326 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 TSPAN15O95858 294 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 IGHV1-69P01742 117 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 TREML4Q6UXN2 200 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 Q8N6K4 173 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 ZNF709Q8N972 641 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 WNK2Q9Y3S1 2297 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 TRAV20A0A0B4J274 112 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 MPDU1O75352 247 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 NPVFQ9HCQ7 196 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 HIF1ANQ9NWT6 349 aa14.69□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 TRAV40A0A0B4J280 105 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 FNDC10F2Z333 226 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 C17orf112F2Z3M2 114 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 TMEM11P17152 192 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 BRS3P32247 399 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 ELLP55199 621 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 UQCC3Q6UW78 93 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 P2RX4Q99571 388 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 C7orf69Q9H7B7 122 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 VSIRQ9H7M9 311 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 RPRMQ9NS64 109 aa14.68□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 TEX22C9J3V5 150 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 AGPAT2O15120 278 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 REG1AP05451 166 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 FAM106CPP0CH98 169 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 C5orf64Q2M2E5 130 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 TMEM41BQ5BJD5 291 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 Q5PR19 223 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 LINC01356Q8N9X3 169 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 UNC79Q9P2D8 2635 aa14.67□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 H2AFB1P0C5Y9 115 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 GATA3P23771 443 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 AKR1C1Q04828 323 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 FAM120AOSQ5T036 256 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 MBD6Q96DN6 1003 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 APCP25054 2843 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 CNIH1O95406 144 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 AREGP15514 252 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 FFAR4Q5NUL3 377 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 ACSM6Q6P461 480 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 COMMD1Q8N668 190 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 ZNF114Q8NC26 417 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 MGST2Q99735 147 aa14.66□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 POLQO75417 2590 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 APELAP0DMC3 54 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 CD69Q07108 199 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 TEPPQ6URK8 271 aa14.65□□□□□ -0.06
LRRC27-201ENST00000344079 VPS13CQ709C8 3753 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 A0A1B0GV50 99 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 RNF223E7ERA6 249 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 MBP02144 154 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 ZP3P21754 424 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 RAB2AP61019 212 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 SPSB3Q6PJ21 355 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 BRD3OSQ6XYD6 125 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 LFNGQ8NES3 379 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 BPIFCQ8NFQ6 507 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 SFT2D1Q8WV19 159 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 SSMEM1Q8WWF3 244 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 CACNG8Q8WXS5 425 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 LINC00052Q96N35 136 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 BAHCC1Q9P281 2608 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 KRBOX1C9JBD0 128 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 OPRK1P41145 380 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 FXYD3Q14802 87 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 SLC16A13Q7RTY0 426 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 GGTLC1Q9BX51 225 aa14.64□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 CSMD2Q7Z408 3487 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 BTBD17A6NE02 478 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 SOX15O60248 233 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 GAMTQ14353 236 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 ZNF726P1Q15940 193 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 MLANAQ16655 118 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 PVRIGQ6DKI7 326 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 TMEM144Q7Z5S9 345 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa14.63□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LRRC27-201ENST00000344079 C1RLQ9NZP8 487 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.1 ms