RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 NKX2-8O15522 239 aa18.18■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 SLC25A17O43808 307 aa18.18■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 CCNOP22674 350 aa18.18■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 TGFBR3Q03167 851 aa18.18■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 RAB31Q13636 194 aa18.18■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 PIGYQ3MUY2 71 aa18.18■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 OR10AG1Q8NH19 301 aa18.18■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 NPCDR1Q9BY65 106 aa18.18■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 DNAJC13O75165 2243 aa18.18■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 F5H5K5 113 aa18.18■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 GJC3Q8NFK1 279 aa18.18■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 TAAR6Q96RI8 345 aa18.18■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 PMCHL2Q9BQD1 86 aa18.18■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 HTR1DP28221 377 aa18.17■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 TMEM97Q5BJF2 176 aa18.17■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 OSR2Q8N2R0 312 aa18.17■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 MBD6Q96DN6 1003 aa18.17■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 H3BUT2 72 aa18.17■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 CRYGCP07315 174 aa18.17■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 MAGEA5P43359 124 aa18.17■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP18.17■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 ZNF788Q6ZQV5 615 aa18.17■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 VSTM2AQ8TAG5 236 aa18.17■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 TMEM45BQ96B21 275 aa18.17■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 A6NDN8 102 aa18.16■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 RPL24P83731 157 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 KIR3DL3Q8N743 410 aa18.16■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 TTTY12Q9BZ98 90 aa18.16■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 SPINK4O60575 86 aa18.15■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 PSG2P11465 335 aa18.15■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 SRYQ05066 204 aa18.15■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa18.15■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa18.15■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 AAED1Q7RTV5 226 aa18.15■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 ZNF442Q9H7R0 627 aa18.15■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 IGF2RP11717 2491 aa18.15■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 FAM90A26D6RGX4 464 aa18.15■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 AGFG2O95081 481 aa18.15■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 TFF3Q07654 80 aa18.15■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 FAM27BQ5VT28 67 aa18.15■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 SHISA2Q6UWI4 295 aa18.15■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 TMEM204Q9BSN7 226 aa18.15■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 TMEM191AQ9H0A3 160 aa18.15■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 MYO7BQ6PIF6 2116 aa18.15■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 A0A0G2JLM5 398 aa18.14■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 RHBDL1O75783 438 aa18.14■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 PATE4P0C8F1 98 aa18.14■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 DEFA4P12838 97 aa18.14■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 USF1P22415 310 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 FREM1Q5H8C1 2179 aa18.14■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 OR1L1Q8NH94 360 aa18.14■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 LINC00470Q9BZP3 86 aa18.14■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 TNFRSF19Q9NS68 423 aa18.14■□□□□ 0.5
PITX1-201ENST00000265340 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa18.14■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 OR11H12B2RN74 326 aa18.14■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 SLC35E4Q6ICL7 350 aa18.14■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 FOXI2Q6ZQN5 318 aa18.14■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 C2orf91Q6ZV80 131 aa18.14■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 OR11H1Q8NG94 326 aa18.14■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 OR11H2Q8NH07 326 aa18.14■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 PERPQ96FX8 193 aa18.14■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa18.13■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 KLK10O43240 276 aa18.13■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 IGKV1-39P01597 117 aa18.13■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 IGKV1D-39P04432 117 aa18.13■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 B4GALT1P15291 398 aa18.13■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 TMEM251Q8N6I4 163 aa18.13■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 C11orf52Q96A22 123 aa18.13■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 KCNIP1Q9NZI2 227 aa18.13■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 SPCS1Q9Y6A9 102 aa18.13■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 URB1O60287 2271 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa18.13■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa18.13■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa18.13■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 FA2HQ7L5A8 372 aa18.13■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 SAP30LQ9HAJ7 183 aa18.13■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 J3QR89 54 aa18.12■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 VWC2Q2TAL6 325 aa18.12■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 MSRB2Q9Y3D2 182 aa18.12■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 SELENOKQ9Y6D0 94 aa18.12■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa18.12■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 IGKV1-5P01602 117 aa18.12■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 IGHV3-9P01782 118 aa18.12■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 LTC4SQ16873 150 aa18.12■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 SPACA3Q8IXA5 215 aa18.12■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 FGFBP3Q8TAT2 258 aa18.12■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 BLNKQ8WV28 456 aa18.12■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 OSTCQ9NRP0 149 aa18.12■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 CHD8Q9HCK8 2581 aa18.11■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 M0R135 149 aa18.11■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 CLDN1O95832 211 aa18.11■□□□□ 0.49
PITX1-201ENST00000265340 CEACAM16Q2WEN9 425 aa18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms