RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 DEFB108BQ8NET1 73 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-204ENST00000587718 TVP23CQ96ET8 276 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-204ENST00000587718 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-204ENST00000587718 NPCDR1Q9BY65 106 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-204ENST00000587718 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNIP2Q9NS61 270 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-204ENST00000587718 H3BQ15 152 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-204ENST00000587718 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
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CAPNS1-204ENST00000587718 VSIRQ9H7M9 311 aa20.72■□□□□ 0.91
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CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM250H0YL14 139 aa20.67■□□□□ 0.9
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CAPNS1-204ENST00000587718 IGHV4-31P0DP07 118 aa20.67■□□□□ 0.9
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CAPNS1-204ENST00000587718 DYNLRB1Q9NP97 96 aa20.66■□□□□ 0.9
CAPNS1-204ENST00000587718 ENY2Q9NPA8 101 aa20.66■□□□□ 0.9
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM242Q9NWH2 141 aa20.66■□□□□ 0.9
CAPNS1-204ENST00000587718 BET1LQ9NYM9 111 aa20.66■□□□□ 0.9
CAPNS1-204ENST00000587718 C1orf196B1AJZ1 125 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-204ENST00000587718 IGKV1D-33P01593 117 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-204ENST00000587718 IGKV1-33P01594 117 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-204ENST00000587718 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-204ENST00000587718 SSX9Q7RTT3 188 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-204ENST00000587718 SSX7Q7RTT5 188 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC35D1Q9NTN3 355 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-204ENST00000587718 COL6A5A8TX70 2615 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A087X0M5 115 aa20.64■□□□□ 0.9
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1B0GX30 115 aa20.64■□□□□ 0.9
CAPNS1-204ENST00000587718 UPK2O00526 184 aa20.64■□□□□ 0.9
CAPNS1-204ENST00000587718 CT45A6P0DMU7 189 aa20.64■□□□□ 0.9
CAPNS1-204ENST00000587718 CT45A5P0DMU8 189 aa20.64■□□□□ 0.9
CAPNS1-204ENST00000587718 CT45A7P0DMV0 189 aa20.64■□□□□ 0.9
CAPNS1-204ENST00000587718 PSMB3P49720 205 aa20.64■□□□□ 0.9
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