RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		7.12	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		7.12	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		7.12	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	TNC	P24821	2201 aa		7.11	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		7.11	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF785	A8K8V0	405 aa		7.11	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	SERPINE2	P07093	398 aa		7.11	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	OR13C7	P0DN81	318 aa		7.11	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	CBLN1	P23435	193 aa		7.11	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	7.11	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	UCP3	P55916	312 aa		7.11	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	CTF1	Q16619	201 aa		7.11	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		7.11	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	GPR107	Q5VW38	600 aa		7.11	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		7.11	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	PLET1	Q6UQ28	207 aa		7.11	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		7.11	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	HINT2	Q9BX68	163 aa		7.11	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		7.11	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		7.11	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		7.11	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		7.11	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	NSG2	Q9Y328	171 aa		7.11	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		7.11	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	TPPP	O94811	219 aa		7.1	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	GABARAP	O95166	117 aa		7.1	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	IFNA6	P05013	189 aa		7.1	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	SMIM18	P0DKX4	95 aa		7.1	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	CD81	P60033	236 aa		7.1	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	WT1-AS	Q06250	92 aa		7.1	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	GUCA2B	Q16661	112 aa		7.1	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	HAGH	Q16775	308 aa		7.1	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	LAX1	Q8IWV1	398 aa		7.1	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		7.1	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		7.1	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		7.1	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	MUC7	Q8TAX7	377 aa		7.1	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		7.1	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		7.1	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		7.1	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM56	Q96MV1	263 aa		7.1	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	NEURL2	Q9BR09	285 aa		7.1	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	PALMD	Q9NP74	551 aa		7.1	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	KLK11	Q9UBX7	282 aa		7.1	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	PRND	Q9UKY0	176 aa		7.1	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	TENM3	Q9P273	2699 aa		7.09	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479		M0QYG6	137 aa		7.09	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	CD7	P09564	240 aa		7.09	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	EDN2	P20800	178 aa		7.09	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	GPR183	P32249	361 aa		7.09	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	TM4SF20	Q53R12	229 aa		7.09	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		7.09	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		7.09	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	OR5B3	Q8NH48	314 aa		7.09	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	OR4A16	Q8NH70	328 aa		7.09	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		7.09	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	SPATA25	Q9BR10	227 aa		7.09	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		7.09	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		7.09	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
KIFC3-231	ENST00000567479	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		7.08	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM213	A2RRL7	107 aa		7.08	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479		A8MWP6	167 aa		7.08	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	OR11H12	B2RN74	326 aa		7.08	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	TGOLN2	O43493	480 aa		7.08	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	LYL1	P12980	280 aa		7.08	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	PGAM2	P15259	253 aa		7.08	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		7.08	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	GPR141	Q7Z602	305 aa		7.08	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	DEFB125	Q8N687	156 aa		7.08	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	OR52I2	Q8NH67	350 aa		7.08	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		7.08	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	MARC2	Q969Z3	335 aa		7.08	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	SEC22A	Q96IW7	307 aa		7.08	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	CITED4	Q96RK1	184 aa		7.08	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	ABHD1	Q96SE0	405 aa		7.08	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		7.08	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		7.08	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		7.08	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	MLX	Q9UH92	298 aa		7.08	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		7.08	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		7.08	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		7.07	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	OR2T8	A6NH00	312 aa		7.07	□□□□□ -1.28
KIFC3-231	ENST00000567479	DBX1	A6NMT0	343 aa		7.07	□□□□□ -1.28

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