RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566497.5

MFGE8-215, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene MFGE8, Length 1,689 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-215ENST00000566497 FNDC10F2Z333 226 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 IFNA10P01566 189 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 RPS10P46783 165 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 FABP9Q0Z7S8 132 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 SLC16A13Q7RTY0 426 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 ZNF383Q8NA42 475 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 CCL17Q92583 94 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 TMEM106BQ9NUM4 274 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 LINC00312Q9Y6C7 94 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 TRAV3A0A0B4J244 114 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 hADV38S2A0JD32 116 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 RRHO14718 337 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 HRASP01112 189 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 OPN1MWP04001 364 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 OPN1MW2P0DN77 364 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 OPN1MW3P0DN78 364 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 UTF1Q5T230 341 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 ZNF343Q6P1L6 599 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 TREML4Q6UXN2 200 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 SSX9Q7RTT3 188 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 TMEM170AQ8WVE7 144 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 CCL13Q99616 98 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa13.12□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 BTF3P20290 206 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 HOXA5P20719 270 aa13.11□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 RAB4BP61018 213 aa13.11□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 OR4A47Q6IF82 309 aa13.11□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 RHOVQ96L33 236 aa13.11□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 SMIM7Q9BQ49 75 aa13.11□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 TXNDC17Q9BRA2 123 aa13.11□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 KCNIP2Q9NS61 270 aa13.11□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa13.11□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa13.1□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 VENTXO95231 258 aa13.1□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 GYPAP02724 150 aa13.1□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 RPS16P62249 146 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa13.1□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 PYGO2Q9BRQ0 406 aa13.1□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 NPVFQ9HCQ7 196 aa13.1□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 PRNDQ9UKY0 176 aa13.1□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 NKX6-3A6NJ46 265 aa13.09□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 TMEM178BH3BS89 294 aa13.09□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 YIF1AO95070 293 aa13.09□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 DEFA6Q01524 100 aa13.09□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 LYG1Q8N1E2 194 aa13.09□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 FAM216BQ8N7L0 139 aa13.09□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 FAM210BQ96KR6 192 aa13.09□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa13.08□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 OVOL3O00110 214 aa13.08□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 LY6HO94772 140 aa13.08□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 IGHV3-7P01780 117 aa13.08□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 RPL23P62829 140 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 ZNF674Q2M3X9 581 aa13.08□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 BSXQ3C1V8 233 aa13.08□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 ABHD12Q8N2K0 398 aa13.08□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 DEFB108BQ8NET1 73 aa13.08□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 IGFBPL1Q8WX77 278 aa13.08□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 LEAP2Q969E1 77 aa13.08□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 MGST2Q99735 147 aa13.08□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 GGTLC1Q9BX51 225 aa13.08□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 PARLQ9H300 379 aa13.08□□□□□ -0.31
MFGE8-215ENST00000566497 LRBAP50851 2863 aa13.08□□□□□ -0.32
MFGE8-215ENST00000566497 PPIAL4EA0A075B759 164 aa13.08□□□□□ -0.32
MFGE8-215ENST00000566497 PPIAL4DF5H284 164 aa13.08□□□□□ -0.32
MFGE8-215ENST00000566497 UPK2O00526 184 aa13.08□□□□□ -0.32
MFGE8-215ENST00000566497 PDE6DO43924 150 aa13.08□□□□□ -0.32
MFGE8-215ENST00000566497 PAGE4O60829 102 aa13.08□□□□□ -0.32
MFGE8-215ENST00000566497 PFN1P07737 140 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
MFGE8-215ENST00000566497 CT45A6P0DMU7 189 aa13.08□□□□□ -0.32
MFGE8-215ENST00000566497 CT45A5P0DMU8 189 aa13.08□□□□□ -0.32
MFGE8-215ENST00000566497 CT45A7P0DMV0 189 aa13.08□□□□□ -0.32
MFGE8-215ENST00000566497 PPIAL4FP0DN26 164 aa13.08□□□□□ -0.32
MFGE8-215ENST00000566497 EFNA4P52798 201 aa13.08□□□□□ -0.32
MFGE8-215ENST00000566497 HNF4GQ14541 408 aa13.08□□□□□ -0.32
MFGE8-215ENST00000566497 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa13.08□□□□□ -0.32
MFGE8-215ENST00000566497 C8orf31Q8N9H6 132 aa13.08□□□□□ -0.32
MFGE8-215ENST00000566497 OR4F5Q8NH21 305 aa13.08□□□□□ -0.32
MFGE8-215ENST00000566497 C1orf159Q96HA4 380 aa13.08□□□□□ -0.32
MFGE8-215ENST00000566497 OR4F4Q96R69 305 aa13.08□□□□□ -0.32
MFGE8-215ENST00000566497 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa13.08□□□□□ -0.32
MFGE8-215ENST00000566497 PPIAL4AQ9Y536 164 aa13.08□□□□□ -0.32
MFGE8-215ENST00000566497 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa13.08□□□□□ -0.32
MFGE8-215ENST00000566497 DCHS2Q6V1P9 2916 aa13.07□□□□□ -0.32
MFGE8-215ENST00000566497 DSCAML1Q8TD84 2053 aa13.07□□□□□ -0.32
MFGE8-215ENST00000566497 LYNX1G3V0Z9 82 aa13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms