RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	OR51J1	Q9H342	316 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	KLK11	Q9UBX7	282 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	GAB2	Q9UQC2	676 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	SORL1	Q92673	2214 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	MSGN1	A6NI15	193 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	TEX22	C9J3V5	150 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	RAB3D	O95716	219 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	HRAS	P01112	189 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	IGHV3-11	P01762	117 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	TRGV3	P03979	118 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	RLN1	P04808	185 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	RCVRN	P35243	200 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	LPAR6	P43657	344 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	PPP5C	P53041	499 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	VAMP2	P63027	116 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	CX3CL1	P78423	397 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	CATR1	Q13166	79 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF846	Q147U1	533 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	ACTBL2	Q562R1	376 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	NPB	Q8NG41	125 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	GPX8	Q8TED1	209 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	SNAPC3	Q92966	411 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	C5orf30	Q96GV9	206 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	ABHD1	Q96SE0	405 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	RNF5	Q99942	180 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	MCUB	Q9NWR8	336 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	COA4	Q9NYJ1	87 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A1B0GVG6	124 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	DISC1	C4P0D8	188 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	GABARAP	H6UMI1	98 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	GPR31	O00270	319 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	RAMP3	O60896	148 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	SNAPC5	O75971	98 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	OR2A4	O95047	310 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	KRAS	P01116	189 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	HLA-DRB1	P01911	266 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	CD3D	P04234	171 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	DEFA4	P12838	97 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	GNRHR	P30968	328 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	KIR2DS2	P43631	304 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	RAB9A	P51151	201 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	TPPP2	P59282	170 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	TAS2R19	P59542	299 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	ERVK-16	P61578	105 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	DEFA6	Q01524	100 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	RGS21	Q2M5E4	152 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	DEFB136	Q30KP8	78 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF695	Q8IW36	515 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	COMMD1	Q8N668	190 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	OR4S2	Q8NH73	311 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	ARPC1A	Q92747	370 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF479	Q96JC4	524 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	OR2A7	Q96R45	310 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ATXN3-238	ENST00000556288	MMP27	Q9H306	513 aa		3.62	□□□□□ -1.83

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