RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552294.1

CTDSP2-208, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP2, Length 436 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-208ENST00000552294 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 CCL28Q9NRJ3 127 aa4.83□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 NSG2Q9Y328 171 aa4.83□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 TRAV10A0A0B4J240 114 aa4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 DPPA5A6NC42 116 aa4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 EFCAB10A6NFE3 127 aa4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 C15orf61A6NNL5 157 aa4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 C16orf90A8MZG2 172 aa4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 UPK2O00526 184 aa4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 ATP8B1O43520 1251 aa4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 DENRO43583 198 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 DFFBO76075 338 aa4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 ACTL6BO94805 426 aa4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 PRM2P04554 102 aa4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 CDK1P06493 297 aa4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 OR13C7P0DN81 318 aa4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 RRASP10301 218 aa4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 DEFA4P12838 97 aa4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 MAS1LP35410 378 aa4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 RPL8P62917 257 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 IRF3Q14653 427 aa4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 HSD17B12Q53GQ0 312 aa4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 LCE3BQ5TA77 95 aa4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 LIPKQ5VXJ0 399 aa4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 GLT8D1Q68CQ7 371 aa4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 UBAC2Q8NBM4 344 aa4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 PHYHIPQ92561 330 aa4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 GINS4Q9BRT9 223 aa4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 RNF126Q9BV68 326 aa4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 MS4A6AQ9H2W1 248 aa4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 HRH4Q9H3N8 390 aa4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 NACAE9PAV3 2078 aa4.81□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 A0A1B0GU03 582 aa4.81□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 C11orf94C9JXX5 98 aa4.81□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 SULT1C2O00338 296 aa4.81□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 NDUFA4O00483 81 aa4.81□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 SERPINB10P48595 397 aa4.81□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 TCTAP57738 103 aa4.81□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 FABP5Q01469 135 aa4.81□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 RAB11BQ15907 218 aa4.81□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC25A24Q6NUK1 477 aa4.81□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 TCF24Q7RTU0 167 aa4.81□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC25A42Q86VD7 318 aa4.81□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 TMEM116Q8NCL8 245 aa4.81□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa4.81□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 OR56B1Q8NGI3 324 aa4.81□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 OR10R2Q8NGX6 335 aa4.81□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 RAB3CQ96E17 227 aa4.81□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 ADTRPQ96IZ2 230 aa4.81□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4.81□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 PLGRKTQ9HBL7 147 aa4.81□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 S100A14Q9HCY8 104 aa4.81□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 OR2W1Q9Y3N9 320 aa4.81□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 DNAH8Q96JB1 4490 aa4.81□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 I3L2K1 104 aa4.8□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 K7EMT4 169 aa4.8□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 SERPINE2P07093 398 aa4.8□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 PPP5CP53041 499 aa4.8□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 TAS2R43P59537 309 aa4.8□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 CBX3Q13185 183 aa4.8□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 MLANAQ16655 118 aa4.8□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa4.8□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 TOMM20LQ6UXN7 152 aa4.8□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 PQLC1Q8N2U9 271 aa4.8□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 GDPD1Q8N9F7 314 aa4.8□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 VN1R17PQ8TDU5 208 aa4.8□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 OR10C1Q96KK4 312 aa4.8□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 CXorf58Q96LI9 332 aa4.8□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 C9orf16Q9BUW7 83 aa4.8□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 ZFAND3Q9H8U3 227 aa4.8□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 HRASLSQ9HDD0 168 aa4.8□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 BET1LQ9NYM9 111 aa4.8□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 C21orf62Q9NYP8 219 aa4.8□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 MGAT4AQ9UM21 535 aa4.8□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 TMEM235A6NFC5 223 aa4.79□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 C15orf62A8K5M9 175 aa4.79□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 MYL12BO14950 172 aa4.79□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF688P0C7X2 276 aa4.79□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 P0DMU3 169 aa4.79□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 FAM231AP0DMU4 169 aa4.79□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 FAM231CP0DMU5 169 aa4.79□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 CALRP27797 417 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 MAP2K4P45985 399 aa4.79□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 EMP1P54849 157 aa4.79□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 FXYD7P58549 80 aa4.79□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 TPBGQ13641 420 aa4.79□□□□□ -1.64
CTDSP2-208ENST00000552294 MED22Q15528 200 aa4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms