RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 SLC25A24Q6NUK1 477 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 AHSA2Q719I0 299 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 MFSD4AQ8N468 514 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 GDPD1Q8N9F7 314 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 OR10R2Q8NGX6 335 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 CYGBQ8WWM9 190 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 SPATA2Q9UM82 520 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-228ENST00000551473 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 A0A075B6Q4 140 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 RBMY1CP0DJD4 496 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 SPP1P10451 314 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 NPY1RP25929 384 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 CLDN12P56749 244 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 PLA2G7Q13093 441 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 Q56UQ5 140 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 PQLC1Q8N2U9 271 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 UBAC2Q8NBM4 344 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 CHRDL1Q9BU40 450 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 TAS2R8Q9NYW2 309 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 METTL21EPA6NDL7 271 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 YIF1AO95070 293 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 IGLV2-14P01704 120 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 SERPINE2P07093 398 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 NQO2P16083 231 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 TAS2R31P59538 309 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 TRAM1Q15629 374 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 GIMAP1Q8WWP7 306 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 UFD1Q92890 307 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 GFI1Q99684 422 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 V9GY05 133 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 C16orf90A8MZG2 172 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 UPK2O00526 184 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 TRAPPC2P0DI81 140 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 TRAPPC2BP0DI82 140 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 OR13C7P0DN81 318 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 RAB6AP20340 208 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 DEFB131AP59861 70 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 CATR1Q13166 79 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 SPHARQ15513 63 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 MSMO1Q15800 293 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 POU2AF1Q16633 256 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 CNIH2Q6PI25 160 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 TCF24Q7RTU0 167 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 GBGT1Q8N5D6 347 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 SCARB1Q8WTV0 552 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 OR10C1Q96KK4 312 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 GINS3Q9BRX5 216 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 DCSTAMPQ9H295 470 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 C8orf4Q9NR00 106 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 HPRT1P00492 218 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 IGKV1-13P0DP09 117 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 BRWD1-AS2P59051 145 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 LEMD1Q68G75 181 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 Q6ZR54 194 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 SPAG16Q8N0X2 631 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 DHRSXQ8N5I4 330 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 ZBTB34Q8NCN2 500 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 DUSP18Q8NEJ0 188 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 FAM210BQ96KR6 192 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 S100A14Q9HCY8 104 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 TMEM14BQ9NUH8 114 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 TBC1D24Q9ULP9 559 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 F8W735 103 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 PDCD5O14737 125 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 ST8SIA3O43173 380 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 CTSGP08311 255 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 CALRP27797 417 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 ARPC4P59998 168 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-228ENST00000551473 HES5Q5TA89 166 aa8.6□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms