RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529828.5

PTPRC-213, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 2,336 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-213ENST00000529828 HLA-DRB3P79483 266 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 ZNF585BQ52M93 769 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 LY6G6FQ5SQ64 297 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 MEDAGQ5VYS4 303 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 CLEC19AQ6UXS0 136 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 Q6ZWC4 215 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 WFDC3Q8IUB2 231 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 FAM223AQ8IWN6 122 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 TMEM217Q8N7C4 229 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 STPG3Q8N7X2 389 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 C11orf45Q8TAV5 145 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 MAFIPQ8WZ33 124 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 NEDD4LQ96PU5 975 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 RNF5Q99942 180 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 IFT46Q9NQC8 304 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 CLEC5AQ9NY25 188 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 CKLFQ9UBR5 152 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 ZNF221Q9UK13 617 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 AP4S1Q9Y587 144 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 A0A0A6YYD4 124 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 PRSS29PA6NIE9 313 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 FAM90A7PA6NKC0 464 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 TMEM238C9JI98 176 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 F8WDY8 70 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 NAPSAO96009 420 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 IFNA4P05014 189 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 S100A8P05109 93 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 CD36P16671 472 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 GABRB1P18505 474 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 SRMP19623 302 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 ZBTB25P24278 435 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 INSL4Q14641 139 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 PRSS8Q16651 343 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 ODF3L2Q3SX64 289 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 Q499Y3 187 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 OR2B11Q5JQS5 317 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 ZNF880Q6PDB4 577 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 LINC00299Q6ZSB3 139 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 CEACAM19Q7Z692 300 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 APRG1Q8IVJ8 170 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 OR2D3Q8NGH3 330 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 C2CD4CQ8TF44 421 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 GGHQ92820 318 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 MRGPRFQ96AM1 343 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 SMIM19Q96E16 107 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 CCDC140Q96MF4 163 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 CCDC90BQ9GZT6 254 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 OR2D2Q9H210 308 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 RDH8Q9NYR8 311 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 AK3Q9UIJ7 227 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 FBXL7Q9UJT9 491 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 RAB26Q9ULW5 256 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-213ENST00000529828 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa2.59□□□□□ -2
PTPRC-213ENST00000529828 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa2.59□□□□□ -2
PTPRC-213ENST00000529828 SMIM30A4D0T7 59 aa2.59□□□□□ -2
PTPRC-213ENST00000529828 J3QRK9 145 aa2.59□□□□□ -2
PTPRC-213ENST00000529828 RAB27BO00194 218 aa2.59□□□□□ -2
PTPRC-213ENST00000529828 RTL8CO15255 209 aa2.59□□□□□ -2
PTPRC-213ENST00000529828 TCAPO15273 167 aa2.59□□□□□ -2
PTPRC-213ENST00000529828 SOCS1O15524 211 aa2.59□□□□□ -2
PTPRC-213ENST00000529828 SCGB2A1O75556 95 aa2.59□□□□□ -2
PTPRC-213ENST00000529828 ALPLP05186 524 aa2.59□□□□□ -2
PTPRC-213ENST00000529828 REG1AP05451 166 aa2.59□□□□□ -2
PTPRC-213ENST00000529828 CDK1P06493 297 aa2.59□□□□□ -2
PTPRC-213ENST00000529828 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -2
PTPRC-213ENST00000529828 MYOD1P15172 320 aa2.59□□□□□ -2
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PTPRC-213ENST00000529828 NQO2P16083 231 aa2.59□□□□□ -2
PTPRC-213ENST00000529828 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP2.59□□□□□ -2
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PTPRC-213ENST00000529828 ANKRD55Q3KP44 614 aa2.59□□□□□ -2
PTPRC-213ENST00000529828 TMEM177Q53S58 311 aa2.59□□□□□ -2
PTPRC-213ENST00000529828 HACD4Q5VWC8 232 aa2.59□□□□□ -2
PTPRC-213ENST00000529828 LINC00336Q6ZUF6 198 aa2.59□□□□□ -2
PTPRC-213ENST00000529828 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa2.59□□□□□ -2
PTPRC-213ENST00000529828 GVQW1Q8N7I0 195 aa2.59□□□□□ -2
PTPRC-213ENST00000529828 NHLRC2Q8NBF2 726 aa2.59□□□□□ -2
PTPRC-213ENST00000529828 NECAP1Q8NC96 275 aa2.59□□□□□ -2
PTPRC-213ENST00000529828 CLRN3Q8NCR9 226 aa2.59□□□□□ -2
PTPRC-213ENST00000529828 NUDT10Q8NFP7 164 aa2.59□□□□□ -2
PTPRC-213ENST00000529828 APH1BQ8WW43 257 aa2.59□□□□□ -2
PTPRC-213ENST00000529828 UFD1Q92890 307 aa2.59□□□□□ -2
PTPRC-213ENST00000529828 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -2
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