RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528847.1

RPS3-211, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

TSL 5

Gene RPS3, Length 639 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-211ENST00000528847 TMEM116Q8NCL8 245 aa7.25□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 OR56B1Q8NGI3 324 aa7.25□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 GIMAP1Q8WWP7 306 aa7.25□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 SPATA2Q9UM82 520 aa7.25□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 C15orf62A8K5M9 175 aa7.24□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 SLC17A2O00624 439 aa7.24□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 DENRO43583 198 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 HLA-DQB1P01920 261 aa7.24□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 GNB3P16520 340 aa7.24□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 WNT4P56705 351 aa7.24□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 HSD17B12Q53GQ0 312 aa7.24□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 SLC25A24Q6NUK1 477 aa7.24□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 SPSB3Q6PJ21 355 aa7.24□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 MFSD4AQ8N468 514 aa7.24□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 NANOGP1Q8N7R0 232 aa7.24□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 OR4S2Q8NH73 311 aa7.24□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 SCARB1Q8WTV0 552 aa7.24□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa7.24□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 C9orf16Q9BUW7 83 aa7.24□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 PLGRKTQ9HBL7 147 aa7.24□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 CLEC5AQ9NY25 188 aa7.24□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 THYN1Q9P016 225 aa7.24□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 PFDN2Q9UHV9 154 aa7.24□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 A0A075B6Q4 140 aa7.23□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa7.23□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 IFNA21P01568 189 aa7.23□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 IFNA17P01571 189 aa7.23□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 CTSGP08311 255 aa7.23□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 UCHL1P09936 223 aa7.23□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 C4BPBP20851 252 aa7.23□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa7.23□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 SOHLH1Q5JUK2 328 aa7.23□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 CENPSQ8N2Z9 138 aa7.23□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 UBAC2Q8NBM4 344 aa7.23□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.23□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 FAM3DQ96BQ1 224 aa7.23□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 RAB3CQ96E17 227 aa7.23□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 HRASLSQ9HDD0 168 aa7.23□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 BET1LQ9NYM9 111 aa7.23□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 C21orf62Q9NYP8 219 aa7.23□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 TAS2R8Q9NYW2 309 aa7.23□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 OR2W1Q9Y3N9 320 aa7.23□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 UPK2O00526 184 aa7.22□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 MFNGO00587 321 aa7.22□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 MYL12BO14950 172 aa7.22□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 HRASP01112 189 aa7.22□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 APOHP02749 345 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 SERPINE2P07093 398 aa7.22□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 OR13C7P0DN81 318 aa7.22□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 CD36P16671 472 aa7.22□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 WT1-ASQ06250 92 aa7.22□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 RAB11BQ15907 218 aa7.22□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 LAIR2Q6ISS4 152 aa7.22□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 TCF24Q7RTU0 167 aa7.22□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa7.22□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 STHQ8IWL8 128 aa7.22□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 MS4A15Q8N5U1 240 aa7.22□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 GDPD1Q8N9F7 314 aa7.22□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 ZNF555Q8NEP9 628 aa7.22□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 OR10C1Q96KK4 312 aa7.22□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7.22□□□□□ -1.25
RPS3-211ENST00000528847 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa7.21□□□□□ -1.26
RPS3-211ENST00000528847 KNCNA6PVL3 124 aa7.21□□□□□ -1.26
RPS3-211ENST00000528847 K7EIM0 57 aa7.21□□□□□ -1.26
RPS3-211ENST00000528847 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RPS3-211ENST00000528847 CIB2O75838 187 aa7.21□□□□□ -1.26
RPS3-211ENST00000528847 Q56UQ5 140 aa7.21□□□□□ -1.26
RPS3-211ENST00000528847 ZNF773Q6PK81 442 aa7.21□□□□□ -1.26
RPS3-211ENST00000528847 TMEM91Q6ZNR0 172 aa7.21□□□□□ -1.26
RPS3-211ENST00000528847 Q6ZS49 121 aa7.21□□□□□ -1.26
RPS3-211ENST00000528847 OR10R2Q8NGX6 335 aa7.21□□□□□ -1.26
RPS3-211ENST00000528847 ST8SIA2Q92186 375 aa7.21□□□□□ -1.26
RPS3-211ENST00000528847 TMEM203Q969S6 136 aa7.21□□□□□ -1.26
RPS3-211ENST00000528847 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RPS3-211ENST00000528847 CMTM3Q96MX0 182 aa7.21□□□□□ -1.26
RPS3-211ENST00000528847 RAB22AQ9UL26 194 aa7.21□□□□□ -1.26
RPS3-211ENST00000528847 TBC1D24Q9ULP9 559 aa7.21□□□□□ -1.26
RPS3-211ENST00000528847 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa7.2□□□□□ -1.26
RPS3-211ENST00000528847 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa7.2□□□□□ -1.26
RPS3-211ENST00000528847 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RPS3-211ENST00000528847 TNFSF12O43508 249 aa7.2□□□□□ -1.26
RPS3-211ENST00000528847 DFFBO76075 338 aa7.2□□□□□ -1.26
RPS3-211ENST00000528847 SLC22A5O76082 557 aa7.2□□□□□ -1.26
RPS3-211ENST00000528847 YIF1AO95070 293 aa7.2□□□□□ -1.26
RPS3-211ENST00000528847 GHRHP01286 108 aa7.2□□□□□ -1.26
RPS3-211ENST00000528847 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RPS3-211ENST00000528847 PAFAH1B2P68402 229 aa7.2□□□□□ -1.26
RPS3-211ENST00000528847 HES5Q5TA89 166 aa7.2□□□□□ -1.26
RPS3-211ENST00000528847 AHSA2Q719I0 299 aa7.2□□□□□ -1.26
RPS3-211ENST00000528847 ATP6V0BQ99437 205 aa7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms