RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523077.1

HSF4-223, Transcript of heat shock transcription factor 4, human

TSL 2

Gene HSF4, Length 828 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HSF4-223	ENST00000523077	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-223	ENST00000523077	F2R	P25116	425 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-223	ENST00000523077	HLA-DMA	P28067	261 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-223	ENST00000523077	GPR183	P32249	361 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-223	ENST00000523077	PRSS3	P35030	304 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-223	ENST00000523077	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-223	ENST00000523077	TUBA4B	Q9H853	241 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-223	ENST00000523077	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-223	ENST00000523077	NSG2	Q9Y328	171 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HSF4-223	ENST00000523077	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	DBX1	A6NMT0	343 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	SMIM18	P0DKX4	95 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	G6PC	P35575	357 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	LPAR6	P43657	344 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	DEFB125	Q8N687	156 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	GPR31	O00270	319 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	HPGDS	O60760	199 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	APOA1	P02647	267 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	IFNA6	P05013	189 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	CLEC3B	P05452	202 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	ELK1	P19419	428 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	GUCA2B	Q16661	112 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	TM4SF20	Q53R12	229 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	BORCS5	Q969J3	196 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	CXorf58	Q96LI9	332 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	ZNF320	A2RRD8	509 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	TPPP	O94811	219 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	KRAS	P01116	189 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	SERPINE2	P07093	398 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	OR13C7	P0DN81	318 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	ERVK-16	P61578	105 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	BTNL8	Q6UX41	500 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077		F8W735	103 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	OR11H12	B2RN74	326 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	IGKV1-39	P01597	117 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	IGKV1D-39	P04432	117 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	CTF1	Q16619	201 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	HINT2	Q9BX68	163 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	OR2T8	A6NH00	312 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	C15orf61	A6NNL5	157 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077		K7EIM0	57 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077		M0QYG6	137 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	TGOLN2	O43493	480 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	C8orf88	P0DMB2	117 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	RCVRN	P35243	200 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	CADM3	Q8N126	398 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	CMTM3	Q96MX0	182 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	GABARAP	O95166	117 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	PLET1	Q6UQ28	207 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	SEC22A	Q96IW7	307 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HSF4-223	ENST00000523077	ADM	P35318	185 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HSF4-223	ENST00000523077	TSPAN5	P62079	268 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HSF4-223	ENST00000523077	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
HSF4-223	ENST00000523077	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HSF4-223	ENST00000523077	THYN1	Q9P016	225 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HSF4-223	ENST00000523077	KLK11	Q9UBX7	282 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HSF4-223	ENST00000523077	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HSF4-223	ENST00000523077	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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