RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487539.1

CNN3-206, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 739 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-206ENST00000487539 SPART-AS1P0CW21 52 aa2.86□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 DUTP33316 252 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 STX1BP61266 288 aa2.86□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 SRPXP78539 464 aa2.86□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 HTD2P86397 168 aa2.86□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 PAX5Q02548 391 aa2.86□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 TSPAN31Q12999 210 aa2.86□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 Q3ZCU0 254 aa2.86□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 BCL2L15Q5TBC7 163 aa2.86□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 DHRS11Q6UWP2 260 aa2.86□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 FAM223AQ8IWN6 122 aa2.86□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 NECAP1Q8NC96 275 aa2.86□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa2.86□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 C10orf35Q96D05 121 aa2.86□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 ABHD14BQ96IU4 210 aa2.86□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 PHB2Q99623 299 aa2.86□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa2.86□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 OCR1Q9BZK8 76 aa2.86□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 OR2S2Q9NQN1 319 aa2.86□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 TMEM14BQ9NUH8 114 aa2.86□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 IL20Q9NYY1 176 aa2.86□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 LGALS13Q9UHV8 139 aa2.86□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 LAMP5Q9UJQ1 280 aa2.86□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 WASHC3Q9Y3C0 194 aa2.86□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 E7EUB6 86 aa2.85□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 SYT7O43581 403 aa2.85□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 GMNNO75496 209 aa2.85□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 PRM2P04554 102 aa2.85□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 REG1AP05451 166 aa2.85□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 CASQ1P31415 396 aa2.85□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 RIDAP52758 137 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 BLVRAP53004 296 aa2.85□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 CCL18P55774 89 aa2.85□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 LIPEQ05469 1076 aa2.85□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 ESRGQ1W209 222 aa2.85□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 ATAD3CQ5T2N8 411 aa2.85□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa2.85□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 IDO2Q6ZQW0 420 aa2.85□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 TMUB2Q71RG4 321 aa2.85□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 SSX6Q7RTT6 188 aa2.85□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 COX8CQ7Z4L0 72 aa2.85□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 CROCCP3Q8IVE0 287 aa2.85□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 ZNF679Q8IYX0 411 aa2.85□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 MARC2Q969Z3 335 aa2.85□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 C11orf52Q96A22 123 aa2.85□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 FGGYQ96C11 551 aa2.85□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 OPALINQ96PE5 141 aa2.85□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 NEK6Q9HC98 313 aa2.85□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 CMTM6Q9NX76 183 aa2.85□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 XCL2Q9UBD3 114 aa2.85□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 IKZF2Q9UKS7 526 aa2.85□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 R4GMQ9 66 aa2.85□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 CCDC182A6NF36 153 aa2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 DHRS7CA6NNS2 312 aa2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 E5RGE8 158 aa2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 AIPO00170 330 aa2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 CHEK1O14757 476 aa2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 ANGPT2O15123 496 aa2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 GATBO75879 557 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 GADD45GO95257 159 aa2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 MT-ND2P03891 347 aa2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 GALP22466 123 aa2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 SLC2A5P22732 501 aa2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 FCGR2CP31995 323 aa2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 TNXAQ16473 311 aa2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 MICAQ29983 383 aa2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 LINC01620Q4KN68 170 aa2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 ERICH5Q6P6B1 374 aa2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 DEGS2Q6QHC5 323 aa2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 SCXQ7RTU7 201 aa2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 CEACAM19Q7Z692 300 aa2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 STHQ8IWL8 128 aa2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 TTC9CQ8N5M4 171 aa2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 OR13C9Q8NGT0 318 aa2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 CENPOQ9BU64 300 aa2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 MROQ9BYG7 248 aa2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 MOB1AQ9H8S9 216 aa2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 TAF9BQ9HBM6 251 aa2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 CMC2Q9NRP2 79 aa2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 NSG2Q9Y328 171 aa2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 UFC1Q9Y3C8 167 aa2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 V9GYQ6 96 aa2.84□□□□□ -1.95
CNN3-206ENST00000487539 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa2.83□□□□□ -1.96
CNN3-206ENST00000487539 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa2.83□□□□□ -1.96
CNN3-206ENST00000487539 OR5H14A6NHG9 310 aa2.83□□□□□ -1.96
CNN3-206ENST00000487539 RIIAD1A6NNX1 92 aa2.83□□□□□ -1.96
CNN3-206ENST00000487539 A8MU10 97 aa2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms