RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	FCN1	O00602	326 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	TAAR5	O14804	337 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	ARPC5	O15511	151 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	SSSCA1	O60232	199 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	CD24	P25063	80 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	PAX6	P26367	422 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	CHRNA7	P36544	502 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	BAX	Q07812	192 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM86B	Q8N661	226 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	ZAN	Q9Y493	2812 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	CGB1	A6NKQ9	187 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	ACTL6B	O94805	426 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	S100A11	P31949	105 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	SCGB2A2	Q13296	93 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	TMUB2	Q71RG4	321 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM68	Q96MH6	324 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	CLCC1	Q96S66	551 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529		E7EUB6	86 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	HNF1A	P20823	631 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	HTR2B	P41595	481 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	SULT1A1	P50225	295 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	CX3CL1	P78423	397 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	KLK9	Q2XQG4	91 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	FBLN7	Q53RD9	439 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	C2orf83	Q53S99	150 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF114	Q8NC26	417 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	ENY2	Q9NPA8	101 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF580	Q9UK33	172 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	HSPB11	Q9Y547	144 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A1B0GW64	132 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	MSGN1	A6NI15	193 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	TEX22	C9J3V5	150 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529		H3BUX3	64 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	AMY1A	P04745	511 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	10.11	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	PLGLA	Q15195	96 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	GGACT	Q9BVM4	153 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	GON7	Q9BXV9	100 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	IGSF23	A1L1A6	192 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	C15orf62	A8K5M9	175 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	TSPAN9	O75954	239 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	CA2	P00918	260 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	CRYGC	P07315	174 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	CAV2	P51636	162 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	WT1-AS	Q06250	92 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	FXYD3	Q14802	87 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	OPCML	Q14982	345 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	TNXA	Q16473	311 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	ATP6V1F	Q16864	119 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	STX12	Q86Y82	276 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	ARL6	Q9H0F7	186 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	FNDC10	F2Z333	226 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	CLDN34	H7C241	214 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	BCL2L11	O43521	198 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	CRLF1	O75462	422 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	JTB	O76095	146 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	NXPH3	O95157	252 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	CNIH1	O95406	144 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	IAPP	P10997	89 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAF4-208	ENST00000469529	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79

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