RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 AREGP15514 252 aa6.91□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 FOXE3Q13461 319 aa6.91□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 SPINK9Q5DT21 86 aa6.91□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 NMSQ5H8A3 153 aa6.91□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM65Q6PI78 240 aa6.91□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.91□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.91□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 UXS1Q8NBZ7 420 aa6.91□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.91□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.91□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 OR5B3Q8NH48 314 aa6.91□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 MS4A10Q96PG2 267 aa6.91□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 CITED1Q99966 193 aa6.91□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 KLK15Q9H2R5 256 aa6.91□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.91□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa6.91□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.91□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 ANK2Q01484 3957 aa6.91□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 PLXNB1O43157 2135 aa6.91□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.9□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.9□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 ADAP1O75689 374 aa6.9□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 PRH1P02810 166 aa6.9□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 IL5P05113 134 aa6.9□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 ELANEP08246 267 aa6.9□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 SULT1A3P0DMM9 295 aa6.9□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.9□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 PSMB8P28062 276 aa6.9□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 PSMB6P28072 239 aa6.9□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 CD83Q01151 205 aa6.9□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 SMCO1Q147U7 214 aa6.9□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.9□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.9□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF429Q86V71 674 aa6.9□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 COMMD1Q8N668 190 aa6.9□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 OR5M8Q8NGP6 311 aa6.9□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.9□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 MITD1Q8WV92 249 aa6.9□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM68Q96MH6 324 aa6.9□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.9□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.9□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.9□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.9□□□□□ -1.3
CASQ1-202ENST00000467691 A0A1B0GU03 582 aa6.89□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 MPTX1A8MV57 137 aa6.89□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 DHFRP00374 187 aa6.89□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 IFNA21P01568 189 aa6.89□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 TRGV3P03979 118 aa6.89□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 OR13C7P0DN81 318 aa6.89□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 DEFA4P12838 97 aa6.89□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 RAB9AP51151 201 aa6.89□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 TPPP2P59282 170 aa6.89□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 PRCDQ00LT1 54 aa6.89□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 DEFA5Q01523 94 aa6.89□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 WT1-ASQ06250 92 aa6.89□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 RGS21Q2M5E4 152 aa6.89□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.89□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 OR1S1Q8NH92 325 aa6.89□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.89□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 TNCP24821 2201 aa6.88□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 NPIPB5A8MRT5 1133 aa6.88□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 CEBPZOSA8MTT3 80 aa6.88□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.88□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 NUDT19A8MXV4 375 aa6.88□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 FAM25EA8MYX2 175 aa6.88□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 H3BUA1 57 aa6.88□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 CCSO14618 274 aa6.88□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 PRAF2O60831 178 aa6.88□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 CRYGCP07315 174 aa6.88□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 CTRB1P17538 263 aa6.88□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 SPCS3P61009 180 aa6.88□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 AARDQ4LEZ3 155 aa6.88□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.88□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 C18orf65Q6ZTR6 163 aa6.88□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.88□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 RNF152Q8N8N0 203 aa6.88□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa6.88□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 OR52E5Q8NH55 327 aa6.88□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 OR5B12Q96R08 314 aa6.88□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 SLA2Q9H6Q3 261 aa6.88□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 ENY2Q9NPA8 101 aa6.88□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 STAB1Q9NY15 2570 aa6.88□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.87□□□□□ -1.31
CASQ1-202ENST00000467691 SNRPGP15A8MWD9 76 aa6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms