RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 C14orf144Q96I85 54 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 RITA1Q96K30 269 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 RASL11BQ9BPW5 248 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC2A8Q9NY64 477 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 KIAA1456Q9P272 454 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 TNFSF18Q9UNG2 199 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 CLPSL1A2RUU4 121 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 TNFSF12O43508 249 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 IGKV1-16P04430 117 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM177Q53S58 311 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 FAAP20Q6NZ36 180 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 ZFP82Q8N141 532 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 LINC01006Q8NI28 216 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 SEC11CQ9BY50 192 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF702PQ9H963 129 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
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RABGEF1-205ENST00000450873 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 NDUFA3O95167 84 aa8.41□□□□□ -1.06
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RABGEF1-205ENST00000450873 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 C9orf152Q5JTZ5 239 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 OR51S1Q8NGJ8 323 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 OR4S2Q8NH73 311 aa8.41□□□□□ -1.06
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RABGEF1-205ENST00000450873 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 C5orf64Q2M2E5 130 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 OR5M8Q8NGP6 311 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 OR1S2Q8NGQ3 325 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 CD300LFQ8TDQ1 290 aa8.41□□□□□ -1.06
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RABGEF1-205ENST00000450873 GGACTQ9BVM4 153 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 RNF222A6NCQ9 220 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 RND3P61587 244 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 PSG5Q15238 335 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 PHLDA2Q53GA4 152 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 C11orf87Q6NUJ2 197 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 OR51H1Q8NH63 302 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 STOML3Q8TAV4 291 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 RNF114Q9Y508 228 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-205ENST00000450873 COLCA2A8K830 154 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-205ENST00000450873 TCAPO15273 167 aa8.4□□□□□ -1.07
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RABGEF1-205ENST00000450873 Q6ZS46 218 aa8.4□□□□□ -1.07
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RABGEF1-205ENST00000450873 OR13C8Q8NGS7 320 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-205ENST00000450873 MARCH1Q8TCQ1 289 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
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RABGEF1-205ENST00000450873 COMMD9Q9P000 198 aa8.4□□□□□ -1.07
RABGEF1-205ENST00000450873 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
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RABGEF1-205ENST00000450873 PI3P19957 117 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-205ENST00000450873 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-205ENST00000450873 UBE2KP61086 200 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-205ENST00000450873 TREML4Q6UXN2 200 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC35E3Q7Z769 313 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-205ENST00000450873 TEX45Q8NA69 505 aa8.38□□□□□ -1.07
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