RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444609.1

HDAC8-215, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC8, Length 607 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-215ENST00000444609 C6orf201Q7Z4U5 140 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 STXBP6Q8NFX7 210 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 VSTM2AQ8TAG5 236 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 MUL1Q969V5 352 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 LPAP08519 4548 aa6.87□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 LYRM9A8MSI8 78 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 RAB27BO00194 218 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 CYB5BO43169 146 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 RRN3P1Q2M238 152 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 PSMG4Q5JS54 123 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 GGHQ92820 318 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 UQCC2Q9BRT2 126 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 RIBC2Q9H4K1 309 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 GHRLQ9UBU3 117 aa6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 DAPL1A0PJW8 107 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 CBY3A6NI87 242 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 SIVA1O15304 175 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 FCGR3BO75015 233 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 CD2P06729 351 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 HLA-GP17693 338 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 MNAT1P51948 309 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 FXYD7P58549 80 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 RPL8P62917 257 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 TMED1Q13445 227 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 YIF1BQ5BJH7 314 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 C12orf73Q69YU5 71 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 SCXQ7RTU7 201 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 ARHGAP24Q8N264 748 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 C4orf36Q96KX1 117 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 GINS3Q9BRX5 216 aa6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 TRAV3A0A0B4J244 114 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 J3QRE1 110 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 K7EIM0 57 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 ATP6V1G2O95670 118 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 CST1P01037 141 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 CRHBPP24387 322 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 OR2G6Q5TZ20 316 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 AWAT2Q6E213 333 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 OR10K2Q6IF99 312 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 FCGR1BQ92637 280 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 ORAI1Q96D31 301 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 TMEM231Q9H6L2 316 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 MGAT4AQ9UM21 535 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.84□□□□□ -1.31
HDAC8-215ENST00000444609 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.83□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 HELTA6NFD8 242 aa6.83□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 E9PI62 339 aa6.83□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.83□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 SERPINB10P48595 397 aa6.83□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 GDPD1Q8N9F7 314 aa6.83□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 GPR148Q8TDV2 347 aa6.83□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 DNAJC9Q8WXX5 260 aa6.83□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.82□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 ZAR1LA6NP61 321 aa6.82□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 CD3GP09693 182 aa6.82□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 HLA-DRB4P13762 266 aa6.82□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 CELP19835 753 aa6.82□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 FCN2Q15485 313 aa6.82□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 ZNF773Q6PK81 442 aa6.82□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 JAGN1Q8N5M9 183 aa6.82□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 IMPAD1Q9NX62 359 aa6.82□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.82□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 GNGT2O14610 69 aa6.81□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 LCE2BO14633 110 aa6.81□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 IGKV3-20P01619 116 aa6.81□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 SERPINE2P07093 398 aa6.81□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 SRMP19623 302 aa6.81□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 CALB2P22676 271 aa6.81□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 HTR2CP28335 458 aa6.81□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 DHRS2Q13268 280 aa6.81□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 OR2B11Q5JQS5 317 aa6.81□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 Q8N814 137 aa6.81□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 ZNF709Q8N972 641 aa6.81□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.81□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 OR4C16Q8NGL9 310 aa6.81□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 RFKQ969G6 155 aa6.81□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 Q96MT0 163 aa6.81□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 AK3Q9UIJ7 227 aa6.81□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 A0A1W2PS18 150 aa6.8□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 TRDCB7Z8K6 153 aa6.8□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 OR13C7P0DN81 318 aa6.8□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 RAP2AP10114 183 aa6.8□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 M6PRP20645 277 aa6.8□□□□□ -1.32
HDAC8-215ENST00000444609 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.6 ms