RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 RPL15P61313 204 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 PJVKQ0ZLH3 352 aa23.44■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 MED6O75586 246 aa23.43■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 CRYBA1P05813 215 aa23.43■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 OR9G9P0C7N8 305 aa23.43■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 TNFRSF9Q07011 255 aa23.43■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa23.43■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 SYNGR2O43760 224 aa23.42■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 SSSCA1O60232 199 aa23.42■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 HKR1P10072 659 aa23.42■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa23.42■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 C9orf152Q5JTZ5 239 aa23.42■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 Q6ZS46 218 aa23.42■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF429Q86V71 674 aa23.42■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 PRIMA1Q86XR5 153 aa23.42■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 MAGT1Q9H0U3 335 aa23.42■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 TRAV3A0A0B4J244 114 aa23.41■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 HLA-DRB1P01911 266 aa23.41■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 RPL12P30050 165 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 VAMP2P63027 116 aa23.41■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 RELBQ01201 579 aa23.41■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 IFITM2Q01629 132 aa23.41■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 OR52E5Q8NH55 327 aa23.41■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 OR4A16Q8NH70 328 aa23.41■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 OR4A5Q8NH83 315 aa23.41■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 PLXNB1O43157 2135 aa23.41■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 CA2P00918 260 aa23.41■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 TAS2R30P59541 319 aa23.41■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 PRSS8Q16651 343 aa23.41■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 HSPB9Q9BQS6 159 aa23.41■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 PRSS22Q9GZN4 317 aa23.41■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 WSB1Q9Y6I7 421 aa23.41■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 MSGN1A6NI15 193 aa23.4■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 UPK2O00526 184 aa23.4■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
ECHS1-201ENST00000368547 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa23.39■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 BCL2L11O43521 198 aa23.39■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 LY86O95711 162 aa23.39■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 MMD2Q8IY49 270 aa23.39■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 OR2C3Q8N628 320 aa23.39■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 TNCP24821 2201 aa23.38■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 C15orf61A6NNL5 157 aa23.38■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 RGS13O14921 159 aa23.38■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 KCNAB3O43448 404 aa23.38■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 FGF2P09038 288 aa23.38■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 GNB1P62873 340 aa23.38■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 SMIM8Q96KF7 97 aa23.38■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF702PQ9H963 129 aa23.38■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa23.37■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 NXPH3O95157 252 aa23.37■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 PAX9P55771 341 aa23.37■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 RPL8P62917 257 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 CX3CL1P78423 397 aa23.37■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 Q6ZSV7 163 aa23.37■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 ARPC5LQ9BPX5 153 aa23.37■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM14BQ9NUH8 114 aa23.37■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 PRNDQ9UKY0 176 aa23.37■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 TSC22D2O75157 780 aa23.37■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM50AO95807 157 aa23.37■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 SPCS3P61009 180 aa23.37■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 TNXAQ16473 311 aa23.37■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF562Q6V9R5 426 aa23.37■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 SLC51BQ86UW2 128 aa23.37■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 SLC25A31Q9H0C2 315 aa23.37■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 RBKSQ9H477 322 aa23.37■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 LINC01548A6NM66 108 aa23.36■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 TAAR5O14804 337 aa23.36■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 IGHG2P01859 326 aa23.36■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 OR2B8PP59922 312 aa23.36■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 FKBP11Q9NYL4 201 aa23.36■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 TSPAN9O75954 239 aa23.35■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 ACTL6BO94805 426 aa23.35■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 CNIH1O95406 144 aa23.35■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 SLC35E3Q7Z769 313 aa23.35■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa23.35■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa23.35■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 C2CD3Q4AC94 2353 aa23.34■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 MYOD1P15172 320 aa23.34■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 NDPQ00604 133 aa23.34■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 FXYD3Q14802 87 aa23.34■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 Q8N2B8 174 aa23.34■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 MAS1LP35410 378 aa23.33■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 CAV2P51636 162 aa23.33■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 BAXQ07812 192 aa23.33■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 C10orf55Q5SWW7 151 aa23.33■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
ECHS1-201ENST00000368547 OPN1MWP04001 364 aa23.33■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 OPN1MW2P0DN77 364 aa23.33■■□□□ 1.32
ECHS1-201ENST00000368547 OPN1MW3P0DN78 364 aa23.33■■□□□ 1.32
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