RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1W2PN81 502 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 NUDT19A8MXV4 375 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM77I1YAP6 450 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 IGLV2-23P01705 113 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 IFNA4P05014 189 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 MAS1LP35410 378 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 CHRNA7P36544 502 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 SNCAP37840 140 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 PRCDQ00LT1 54 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 PAX8Q06710 450 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 SSX2Q16385 188 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 HCP5Q6MZN7 132 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 THNSL2Q86YJ6 484 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 MMD2Q8IY49 270 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 MALSU1Q96EH3 234 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4C12Q96R67 309 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 GGACTQ9BVM4 153 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 UQCC1Q9NVA1 299 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 B4DSR2 109 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM157AC9JC47 383 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 TIMM23O14925 209 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC25A17O43808 307 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 PRH1P02810 166 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP6V0CP27449 155 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 BRS3P32247 399 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP8.13□□□□□ -1.112e-11■■■■■ 53.8
RABGGTB-201ENST00000319942 ARL16Q0P5N6 197 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 KLRD1Q13241 179 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 PSG5Q15238 335 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 ETV3LQ6ZN32 361 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 COMMD7Q86VX2 200 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 NRGNQ92686 78 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM147Q9BVK8 224 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 KIAA1456Q9P272 454 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 AUP1Q9Y679 476 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 MED13LQ71F56 2210 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1W2PPI3 338 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1W2PRD5 423 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1W2PRF3 423 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1W2PRM7 423 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 C15orf62A8K5M9 175 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 INS-IGF2F8WCM5 200 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 VENTXO95231 258 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 MOSP00540 346 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 OPN1MWP04001 364 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 OPN1MW2P0DN77 364 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 OPN1MW3P0DN78 364 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 GATA3P23771 443 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 NPY1RP25929 384 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 SERF2P84101 59 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 PLGLAQ15195 96 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 PRSS8Q16651 343 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 HAPLN4Q86UW8 402 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF709Q8N972 641 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC24A4Q8NFF2 622 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2T10Q8NGZ9 312 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 MARC2Q969Z3 335 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 RITA1Q96K30 269 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 TBX15Q96SF7 602 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 SIGLEC9Q9Y336 463 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 PMS2P5A8MQ11 134 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 SOX15O60248 233 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM106CPP0CH98 169 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 CAMLGP49069 296 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 DLK1P80370 383 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 HES1Q14469 280 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 DEFB113Q30KQ7 82 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP1R27Q86WC6 154 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP8.12□□□□□ -1.118e-8■□□□□ 8.5
RABGGTB-201ENST00000319942 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 PARP11Q9NR21 331 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXO7Q9Y3I1 522 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAV20A0A0B4J274 112 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 C17orf112F2Z3M2 114 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 TEX46H3BTG2 121 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 RRHO14718 337 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 CA2P00918 260 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 CRYGBP07316 175 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 MSMBP08118 114 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB31Q13636 194 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 HNF4GQ14541 408 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 MMDQ15546 238 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 C2orf83Q53S99 150 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-201ENST00000319942 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa8.11□□□□□ -1.11
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