RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF2Q99496 336 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 C9orf16Q9BUW7 83 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 PECRQ9BY49 303 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF446Q9NWS9 450 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 BET1LQ9NYM9 111 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 C21orf62Q9NYP8 219 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 PTTG2Q9NZH5 202 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAH6Q9C0G6 4158 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 PKHD1P08F94 4074 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 CHEK1O14757 476 aa5.69□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 ST8SIA3O43173 380 aa5.69□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 LALBAP00709 142 aa5.69□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 FCGR3AP08637 254 aa5.69□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 FGF2P09038 288 aa5.69□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 SPART-AS1P0CW21 52 aa5.69□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 RBMY1CP0DJD4 496 aa5.69□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 DEFB131AP59861 70 aa5.69□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 ST3GAL4Q11206 333 aa5.69□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB11BQ15907 218 aa5.69□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 ACSM3Q53FZ2 586 aa5.69□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2B11Q5JQS5 317 aa5.69□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 TCF24Q7RTU0 167 aa5.69□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa5.69□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 CBR4Q8N4T8 237 aa5.69□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 GBGT1Q8N5D6 347 aa5.69□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 GDPD1Q8N9F7 314 aa5.69□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 ATG101Q9BSB4 218 aa5.69□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 CHRDL1Q9BU40 450 aa5.69□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 FAT2Q9NYQ8 4349 aa5.69□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1B0GW64 132 aa5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PS18 150 aa5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 METTL21EPA6NDL7 271 aa5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB27BO00194 218 aa5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC17A2O00624 439 aa5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 DENRO43583 198 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 SCGB2A1O75556 95 aa5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP5HO75947 161 aa5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 CD74P04233 296 aa5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAPPC2P0DI81 140 aa5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAPPC2BP0DI82 140 aa5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 WNT4P56705 351 aa5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 CATR1Q13166 79 aa5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 RCN1Q15293 331 aa5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF124Q15973 351 aa5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 LEMD1Q68G75 181 aa5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 ZFP1Q6P2D0 407 aa5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 C19orf35Q6ZS72 473 aa5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 TXN2Q99757 166 aa5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC90BQ9GZT6 254 aa5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 RABAC1Q9UI14 185 aa5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATA2Q9UM82 520 aa5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2W1Q9Y3N9 320 aa5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAH2Q9P225 4427 aa5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.68□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0A6YYD4 124 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 E7EUB6 86 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 J3QRK9 145 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 ARL6IP5O75915 188 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 SERPINE2P07093 398 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 OR13C7P0DN81 318 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 NQO2P16083 231 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM50BP56557 158 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 TAS2R31P59538 309 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2B8PP59922 312 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 ERVK-16P61578 105 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 QRFPP83859 136 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 C12orf74Q32Q52 190 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 KCTD21Q4G0X4 260 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6ZS49 121 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRTM1Q86UE6 522 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 C6orf223Q8N319 242 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 MFSD4AQ8N468 514 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 C15orf53Q8NAA6 179 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBTB34Q8NCN2 500 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 DMBX1Q8NFW5 382 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 APH1BQ8WW43 257 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 BORCS5Q969J3 196 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 GRAMD2BQ96HH9 432 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 CYYR1Q96J86 154 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM56Q96MV1 263 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 MS4A6AQ9H2W1 248 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 CLEC2DQ9UHP7 191 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB22AQ9UL26 194 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa5.66□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLC7A0M8Q6 106 aa5.66□□□□□ -1.5
PGGT1B-201ENST00000296642 SMIM9A6NGZ8 99 aa5.66□□□□□ -1.5
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