RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027127.13

Sf3b1-201, Transcript of Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sf3b1, Length 6,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 BckdhbQ6P3A8 390 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr93Q6UAH1 312 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr638Q8VH20 321 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Carhsp1Q9CR86 148 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tppp3Q9CRB6 176 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm765B2RVL9 189 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Prss2P07146 246 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pet117P0DJF2 80 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cstl1Q80Y72 140 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Srsf7Q8BL97 267 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tmem230Q8CIB6 120 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr50Q8VGK5 312 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 PigcQ9CXR4 297 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Prss1Q9Z1R9 246 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pcsk5Q04592 1877 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Igkv13-85A0A075B666 115 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 6430628N08RikA0A0U1RQ45 177 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm35060A0A140LIV7 231 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 RnlsA7RDN6 342 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Icam2P35330 277 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rnd3P61588 244 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pax6P63015 422 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 A3galt2Q3V1N9 370 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm10840Q3V2K9 103 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cacfd1Q8BG21 171 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Neil3Q8K203 606 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 MrgprfQ8VCJ6 343 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr1420Q8VF55 309 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rbm7Q9CQT2 265 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tlnrd1Q9ERE8 362 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mtnd6P03925 172 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Prkar2aP12367 401 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 RorcP51450 516 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Wfdc18P62810 74 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Hhipl1Q14DK5 791 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cd300lbQ3U497 209 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Galnt6Q8C7U7 622 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr181Q8VGQ7 317 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Abhd14aQ922Q6 247 aa7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 StrapQ9Z1Z2 350 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Arid1aA2BH40 2283 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Dgat2l6A2ADU8 337 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ccdc188F6WEU2 249 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 SdcbpO08992 299 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 C5ar1P30993 351 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Q8CDS7 251 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vmn1r178Q8R2B6 304 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mansc1Q9CR33 414 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ly6g6dQ9Z1Q3 135 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 1700031F05RikB1AX30 191 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm21981D3Z6Q6 369 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm42957D6RFQ2 366 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 A630073D07RikE9PWS6 100 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fam98cE9PYD1 344 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tesk1O70146 627 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 St6galnac2P70277 373 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Patz1Q5NBY9 687 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ifna13Q80SU4 189 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Sh3bgrl2Q8BG73 107 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ifi27l2bQ8VC49 283 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fyttd1Q91Z49 317 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Neurl1Q923S6 574 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Nkx6-1Q99MA9 365 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rpusd4Q9CWX4 377 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ppp1r1aQ9ERT9 171 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Zfp111Q9R164 701 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Lrrc3cA0A1B0GRI5 255 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ifna2P01573 190 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 GferP56213 198 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Zfp7Q3TFZ4 685 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Spata22Q5SV06 358 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mr1Q8HWB0 341 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr490Q8VFD2 314 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ralgapa1Q6GYP7 2035 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slc6a8Q8VBW1 640 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 2410004P03RikA0A087WQY2 205 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Nxpe5E0CX47 564 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ndufb11O09111 151 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rpl13aP19253 203 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 PpicP30412 212 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Zfp663Q6NXM6 656 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Nanos1Q80WY3 267 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pla2g3Q8BZT7 504 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slc35e1Q8CD26 409 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Sft2d2Q8VD57 159 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Myoz1Q9JK37 296 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pmaip1Q9JM54 103 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Sh2d2aQ9QXK9 374 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 MpdzQ8VBX6 2055 aa7.29□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Col4a4Q9QZR9 1682 aa7.28□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm6594J3QM43 95 aa7.28□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Saa1P05366 122 aa7.28□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gpr12P35412 334 aa7.28□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gcm1P70348 436 aa7.28□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Samt2Q497M0 247 aa7.28□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr91Q7TRL3 312 aa7.28□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 A930004D18RikQ8C8W7 157 aa7.28□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Yif1aQ91XB7 293 aa7.28□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Scgb3a2Q920H1 91 aa7.28□□□□□ -1.24
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Wdr77Q99J09 342 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 53.6 ms