RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611415.4

TNS1-220, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-220ENST00000611415 ZNF236Q9UL36 1845 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 FAM74A4Q5TZK3 123 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 FMC1Q96HJ9 113 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 PRELID3AQ96N28 172 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 RNF222A6NCQ9 220 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 IGFBP2P18065 325 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 PNKDQ8N490 385 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 ICAM4Q14773 271 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 PEX7O00628 323 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 APOHP02749 345 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 Q5PR19 223 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 C14orf144Q96I85 54 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 SDF2L1Q9HCN8 221 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 STPG1Q5TH74 334 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 TEX45Q8NA69 505 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 LOXL4Q96JB6 756 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 RNF115Q9Y4L5 304 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 A0A1W2PQM1 296 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 FGF11Q92914 225 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 C18orf12Q96KH6 178 aa10.13□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 TSPAN13O95857 204 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 HOXA5P20719 270 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 UCP1P25874 307 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 ATP5G3P48201 142 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 LY6EQ16553 131 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 FAM159AQ6UWV7 190 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 ZNRF1Q8ND25 227 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 OR11H12B2RN74 326 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 OR11H1Q8NG94 326 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 OR11H2Q8NH07 326 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 IZUMO1RA6ND01 250 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 C17orf98A8MV24 154 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 C12orf77C9JDV5 145 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 DMRTA1Q5VZB9 504 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 C18orf15Q96N68 181 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 ARID2Q68CP9 1835 aa10.12□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 NBEAP1P0C6P0 100 aa10.11□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 STARD6P59095 220 aa10.11□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 KLRB1Q12918 225 aa10.11□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 PROB1E7EW31 1015 aa10.11□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 RAMP1O60894 148 aa10.11□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 IGHV3-23P01764 117 aa10.11□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 ATRAIDQ6UW56 229 aa10.11□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 WDR82Q6UXN9 313 aa10.11□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 LRTM2Q8N967 370 aa10.11□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 FAM181BA6NEQ2 426 aa10.11□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 BTCP35070 178 aa10.11□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 LINC00114Q6XXX2 140 aa10.11□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 TIMP4Q99727 224 aa10.11□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 SPOCK3Q9BQ16 436 aa10.11□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 ELOVL5Q9NYP7 299 aa10.11□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 SPSB2Q99619 263 aa10.11□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 PARP14Q460N5 1801 aa10.11□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 TM4SF5O14894 197 aa10.11□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 Q6ZT83 130 aa10.11□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 TIAF1O95411 115 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 TMPRSS3P57727 454 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 ZNF525Q8N782 197 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 FAM131CQ96AQ9 280 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 TMEM74BQ9NUR3 256 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 COX6B1P14854 86 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 TMEM170BQ5T4T1 132 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 DNASE2BQ8WZ79 361 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 NEUROG1Q92886 237 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 TUBA4BQ9H853 241 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 ATP5LO75964 103 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 MIR17HGQ75NE6 70 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 ASIPP42127 132 aa10.1□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 A0A1B0GW15 77 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 LDLRAD4O15165 306 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 TTC9CQ8N5M4 171 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 TRAV24A0A0B4J272 114 aa10.09□□□□□ -0.79
TNS1-220ENST00000611415 FOXC2Q99958 501 aa10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.3 ms