RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-211ENST00000582232 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa9.1□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 C2orf68Q2NKX9 166 aa9.1□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 UXS1Q8NBZ7 420 aa9.1□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 OR5M8Q8NGP6 311 aa9.1□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 OR5B3Q8NH48 314 aa9.1□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 OR52E5Q8NH55 327 aa9.1□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 CLCC1Q96S66 551 aa9.1□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 HSPB9Q9BQS6 159 aa9.1□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 ZNF702PQ9H963 129 aa9.1□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 CACNG5Q9UF02 275 aa9.1□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 NSG2Q9Y328 171 aa9.1□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa9.09□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 MPTX1A8MV57 137 aa9.09□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 FAM90A26D6RGX4 464 aa9.09□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 ACTL6BO94805 426 aa9.09□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 NDUFA7O95182 113 aa9.09□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 IGF1P05019 195 aa9.09□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 CRYBA1P05813 215 aa9.09□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 OR2B8PP59922 312 aa9.09□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 FXYD3Q14802 87 aa9.09□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 TNXAQ16473 311 aa9.09□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 Q6ZS46 218 aa9.09□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 Q6ZSV7 163 aa9.09□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 OR1L8Q8NGR8 309 aa9.09□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 OR10C1Q96KK4 312 aa9.09□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 COMMD5Q9GZQ3 224 aa9.09□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 MED28Q9H204 178 aa9.09□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 C16orf95Q9H693 158 aa9.09□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa9.09□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 HSPB7Q9UBY9 170 aa9.09□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 OR51B2Q9Y5P1 312 aa9.09□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 ATRQ13535 2644 aa9.09□□□□□ -0.95
GGA3-211ENST00000582232 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 CGB1A6NKQ9 187 aa9.08□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 E7EUB6 86 aa9.08□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 INS-IGF2F8WCM5 200 aa9.08□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 CCSO14618 274 aa9.08□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 ST8SIA3O43173 380 aa9.08□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 CNIH1O95406 144 aa9.08□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 SPCS3P61009 180 aa9.08□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 NDPQ00604 133 aa9.08□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 PRCDQ00LT1 54 aa9.08□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 ID3Q02535 119 aa9.08□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 IL15RAQ13261 267 aa9.08□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 GSG1LQ6UXU4 331 aa9.08□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 SLC35E3Q7Z769 313 aa9.08□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 OR4D5Q8NGN0 318 aa9.08□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 SGMS2Q8NHU3 365 aa9.08□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 ARPC1AQ92747 370 aa9.08□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 C2orf50Q96LR7 162 aa9.08□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 TMEM68Q96MH6 324 aa9.08□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 A0A1B0GW64 132 aa9.07□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 C5orf51A6NDU8 294 aa9.07□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 LINC01548A6NM66 108 aa9.07□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 TEX22C9J3V5 150 aa9.07□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 AP4M1O00189 453 aa9.07□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 GOSR2O14653 212 aa9.07□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 TRAPPC2P0DI81 140 aa9.07□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 TRAPPC2BP0DI82 140 aa9.07□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 MYOD1P15172 320 aa9.07□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 H2BFSP57053 126 aa9.07□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 GNB1P62873 340 aa9.07□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 CYCSP99999 105 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 TNFRSF9Q07011 255 aa9.07□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 FCN2Q15485 313 aa9.07□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 AKIRIN2Q53H80 203 aa9.07□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 C19orf54Q5BKX5 351 aa9.07□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 C9orf152Q5JTZ5 239 aa9.07□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 OR11H7Q8NGC8 314 aa9.07□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 OR1S1Q8NH92 325 aa9.07□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 ASB13Q8WXK3 278 aa9.07□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 PDCD10Q9BUL8 212 aa9.07□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 NMES1Q9C002 83 aa9.07□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 MGAT4CQ9UBM8 478 aa9.07□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 FBXO7Q9Y3I1 522 aa9.07□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa9.06□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 MSGN1A6NI15 193 aa9.06□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 FAM25EA8MYX2 175 aa9.06□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 ATP6V0E1O15342 81 aa9.06□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 IFNA17P01571 189 aa9.06□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 HKR1P10072 659 aa9.06□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 CXCL3P19876 107 aa9.06□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
GGA3-211ENST00000582232 C10orf55Q5SWW7 151 aa9.06□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.7 ms