RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 NCKAP5O14513 1909 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 A0A0U1RQV1 116 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 HMSDA8MTL9 139 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 MCRIP1C9JLW8 97 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 FNDC10F2Z333 226 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 H3BQ15 152 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 GABARAPH6UMI1 98 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 K7EMT4 169 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 SULT2B1O00204 365 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 CCL21O00585 134 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 NPFFO15130 113 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 REM1O75628 298 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 ARL6IP5O75915 188 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 OR2A4O95047 310 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 SLC2A10O95528 541 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 ATP1B1P05026 303 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 KLK2P20151 261 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 MPGP29372 298 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 TSPOP30536 169 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF83P51522 516 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 RND3P61587 244 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF85Q03923 595 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF92Q03936 586 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 HGFACQ04756 655 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 SLC38A11Q08AI6 406 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 CDK5R1Q15078 307 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 TMEM183BQ1AE95 376 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 TDRG1Q3Y452 100 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 Q5XG85 94 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF626Q68DY1 528 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 HEPN1Q6WQI6 88 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 Q6ZRG5 221 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 Q6ZTK2 550 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 C9orf139Q6ZV77 190 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 Q6ZVH6 145 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 CEACAM19Q7Z692 300 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 PIP4P1Q86T03 277 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF695Q8IW36 515 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 LRTM2Q8N967 370 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 OR2M3Q8NG83 312 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 OR52R1Q8NGF1 315 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 OR2A12Q8NGT7 310 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 SPATA3Q8NHX4 192 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 FRZBQ92765 325 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 TSLPQ969D9 159 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 TMEM18Q96B42 140 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 OR2A7Q96R45 310 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 EMC6Q9BV81 110 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF747Q9BV97 191 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 SFXN3Q9BWM7 321 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 GGTLC1Q9BX51 225 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 LINC00597Q9H2U6 94 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 JPT2Q9H910 190 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 CMC2Q9NRP2 79 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 UQCR10Q9UDW1 63 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 MED31Q9Y3C7 131 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 DOCK6Q96HP0 2047 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 TRAV5A0A0B4J249 113 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 A0A0G2JNJ9 132 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 MEIS3P1A6NDR6 274 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 UNC119BA6NIH7 251 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 A6NIN4 97 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 SMKR1H3BMG3 65 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 HIST1H2BKO60814 126 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 ZFAND5O76080 213 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 NDUFB6O95139 128 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 SLPIP03973 132 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 HIST1H2BJP06899 126 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 SLC35G6P0C7Q6 338 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 IGLC6P0CF74 106 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 HIST1H2BOP23527 126 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 HIST1H2BBP33778 126 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 CTRLP40313 264 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP4.49□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 HIST1H2BDP58876 126 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 HIST1H2BCP62807 126 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 AKR1C1Q04828 323 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 PRDX4Q13162 271 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 CATR1Q13166 79 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 MMDQ15546 238 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 HIST2H2BEQ16778 126 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 PHLDA2Q53GA4 152 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 MEIG1Q5JSS6 88 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 FHL5Q5TD97 284 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPN3-211ENST00000562199 TSPO2Q5TGU0 170 aa4.49□□□□□ -1.69
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