RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561518.5

RNPS1-204, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 5

Gene RNPS1, Length 1,092 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-204	ENST00000561518		A0A1B0GW64	132 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNPS1-204	ENST00000561518	C15orf61	A6NNL5	157 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNPS1-204	ENST00000561518	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RNPS1-204	ENST00000561518	TSPAN9	O75954	239 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNPS1-204	ENST00000561518	NXPH3	O95157	252 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNPS1-204	ENST00000561518	IGHG2	P01859	326 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNPS1-204	ENST00000561518	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RNPS1-204	ENST00000561518	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
RNPS1-204	ENST00000561518	ARPC1A	Q92747	370 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNPS1-204	ENST00000561518	OR10C1	Q96KK4	312 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNPS1-204	ENST00000561518	PRND	Q9UKY0	176 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNPS1-204	ENST00000561518	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		13.79	□□□□□ -0.2
RNPS1-204	ENST00000561518	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-204	ENST00000561518	CGB1	A6NKQ9	187 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-204	ENST00000561518	FAM25E	A8MYX2	175 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-204	ENST00000561518	ATP6V0E1	O15342	81 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-204	ENST00000561518	ST8SIA3	O43173	380 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-204	ENST00000561518	ACTL6B	O94805	426 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-204	ENST00000561518	IFNA21	P01568	189 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-204	ENST00000561518	APELA	P0DMC3	54 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-204	ENST00000561518	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-204	ENST00000561518	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-204	ENST00000561518	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-204	ENST00000561518	MAS1L	P35410	378 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-204	ENST00000561518	SPINK9	Q5DT21	86 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-204	ENST00000561518	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-204	ENST00000561518		Q8N2B8	174 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-204	ENST00000561518	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-204	ENST00000561518	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-204	ENST00000561518	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-204	ENST00000561518	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-204	ENST00000561518	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-204	ENST00000561518	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RNPS1-204	ENST00000561518	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	MSGN1	A6NI15	193 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	GOSR2	O14653	212 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	SIX6	O95475	246 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	SMCO1	Q147U7	214 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518		Q6ZNX1	250 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	HINT2	Q9BX68	163 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518		A0A1B0GU03	582 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	C5orf51	A6NDU8	294 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	HMX3	A6NHT5	357 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	KCNAB3	O43448	404 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	NDUFA7	O95182	113 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	ECSCR	Q19T08	205 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	OR1S1	Q8NH92	325 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	LINC01006	Q8NI28	216 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	C16orf95	Q9H693	158 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	TEX22	C9J3V5	150 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518		G3V318	75 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	PITX3	O75364	302 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	HKR1	P10072	659 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	FCN2	Q15485	313 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	ZNF429	Q86V71	674 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	LFNG	Q8NES3	379 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	MED28	Q9H204	178 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	COA4	Q9NYJ1	87 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	NF1	P21359	2839 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	AP4M1	O00189	453 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	IFNA17	P01571	189 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	FGF2	P09038	288 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	SLC25A6	P12236	298 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	AARD	Q4LEZ3	155 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	STPG2	Q8N412	459 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	SPIN2A	Q99865	258 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	PLXNB1	O43157	2135 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	IGF1	P05019	195 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	REG1A	P05451	166 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNPS1-204	ENST00000561518	CXCL3	P19876	107 aa		13.73	□□□□□ -0.21

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