RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777		S4R3C0	116 aa		12.08	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777		A0A1B0GW64	132 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777		H3BMQ9	156 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	SSX5	O60225	188 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	SCGN	O76038	276 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	DHFR	P00374	187 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	HRAS	P01112	189 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	CRYGC	P07315	174 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	AREG	P15514	252 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	CBLN1	P23435	193 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	PSMB6	P28072	239 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	SSX9	Q7RTT3	188 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	CCDC140	Q96MF4	163 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	GPHA2	Q96T91	129 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		12.07	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF320	A2RRD8	509 aa		12.06	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	CTRB1	P17538	263 aa		12.06	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	TMBIM6	P55061	237 aa		12.06	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		12.06	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		12.06	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		12.06	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		12.05	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	MYOD1	P15172	320 aa		12.05	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	KLK9	Q2XQG4	91 aa		12.05	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		12.05	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		12.05	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		12.05	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		12.05	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		12.05	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM213	A2RRL7	107 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	TNFSF12	O43508	249 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	REG1A	P05451	166 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	DEFA4	P12838	97 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	HLA-G	P17693	338 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	ARPC4	P59998	168 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	OR4A47	Q6IF82	309 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	BEST4	Q8NFU0	473 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	BET1L	Q9NYM9	111 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	MLX	Q9UH92	298 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	CGB1	A6NKQ9	187 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777		A8MWP6	167 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	CLEC3B	P05452	202 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	PTHLH	P12272	177 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	FCGR2C	P31995	323 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	MSMO1	Q15800	293 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	OR4A5	Q8NH83	315 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	CXorf58	Q96LI9	332 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
DDX11-222	ENST00000542777	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	TM4SF20	Q53R12	229 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	BTNL8	Q6UX41	500 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	ETV7	Q9Y603	341 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	CCDC160	A6NGH7	325 aa		12.01	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	SULT1C2	O00338	296 aa		12.01	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	HPGDS	O60760	199 aa		12.01	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	PPY	P01298	95 aa		12.01	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	RORC	P51449	518 aa		12.01	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	OR2B8P	P59922	312 aa		12.01	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		12.01	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	HOGA1	Q86XE5	327 aa		12.01	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		12.01	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		12.01	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		12.01	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		12.01	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		12	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		12	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	UPK2	O00526	184 aa		12	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	12	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	HPRT1	P00492	218 aa		12	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	C8orf88	P0DMB2	117 aa		12	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	GPR183	P32249	361 aa		12	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	SCAND1	P57086	179 aa		12	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	TAS2R31	P59538	309 aa		12	□□□□□ -0.49
DDX11-222	ENST00000542777	FXYD4	P59646	89 aa		12	□□□□□ -0.49

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