RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 TREML4Q6UXN2 200 aa10.54□□□□□ -0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 LFNGQ8NES3 379 aa10.54□□□□□ -0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 OR4A16Q8NH70 328 aa10.54□□□□□ -0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM230Q96A57 120 aa10.54□□□□□ -0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 WNT10AQ9GZT5 417 aa10.54□□□□□ -0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 C20orf85Q9H1P6 137 aa10.54□□□□□ -0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 NSG2Q9Y328 171 aa10.54□□□□□ -0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 FBXO7Q9Y3I1 522 aa10.54□□□□□ -0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 TRAV3A0A0B4J244 114 aa10.53□□□□□ -0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 UPK2O00526 184 aa10.53□□□□□ -0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 IGF1P05019 195 aa10.53□□□□□ -0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 UCP1P25874 307 aa10.53□□□□□ -0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 MECP2P51608 486 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP10-3P60369 221 aa10.53□□□□□ -0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 SRPXP78539 464 aa10.53□□□□□ -0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa10.53□□□□□ -0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM128Q5BJH2 165 aa10.53□□□□□ -0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 TEX38Q6PEX7 206 aa10.53□□□□□ -0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 SGMS2Q8NHU3 365 aa10.53□□□□□ -0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 SPIN2AQ99865 258 aa10.53□□□□□ -0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa10.53□□□□□ -0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 NUDT15Q9NV35 164 aa10.53□□□□□ -0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 TBC1D24Q9ULP9 559 aa10.53□□□□□ -0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
PGGT1B-204ENST00000503638 IGKV1-39P01597 117 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 IGKV1D-39P04432 117 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 TCRBP04435 133 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 MYOD1P15172 320 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 MAS1LP35410 378 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 PPP1R1AQ13522 171 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 POU2AF1Q16633 256 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC25A42Q86VD7 318 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 LGI3Q8N145 548 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 OR5T1Q8NG75 326 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 GLYATL2Q8WU03 294 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 PDCD10Q9BUL8 212 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 COA4Q9NYJ1 87 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 PRNDQ9UKY0 176 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 OR51B2Q9Y5P1 312 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 NUDT19A8MXV4 375 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 OR9G9P0C7N8 305 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC6A1P30531 599 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 IFITM3Q01628 133 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 LCNL1Q6ZST4 164 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 COMMD1Q8N668 190 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC35G3Q8N808 338 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 SEC22AQ96IW7 307 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 MS4A10Q96PG2 267 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 HMX3A6NHT5 357 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 SFT2D2O95562 160 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 CDS2O95674 445 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 IFNA17P01571 189 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 IGKV1-5P01602 117 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 H2AFB2P0C5Z0 115 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM187Q14656 261 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 AKIRIN2Q53H80 203 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 LHFPL5Q8TAF8 219 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 GALNT14Q96FL9 552 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 CITED1Q99966 193 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 FKBP11Q9NYL4 201 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 C9orf170A2RU37 121 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 C15orf61A6NNL5 157 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 M0QZ24 198 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 REG1AP05451 166 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 OR4E1P0C645 316 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 TRAPPC2P0DI81 140 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 TRAPPC2BP0DI82 140 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 DEFA4P12838 97 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 TPPP2P59282 170 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 FOXE3Q13461 319 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 OR5M8Q8NGP6 311 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 OR1L8Q8NGR8 309 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 COQ8AQ8NI60 647 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 IL22RA2Q969J5 263 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM56Q96MV1 263 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF580Q9UK33 172 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1B-204ENST00000503638 PLXNB1O43157 2135 aa10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.4 ms