RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481204.5

SKAP2-204, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 5

Gene SKAP2, Length 513 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-204	ENST00000481204	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	LINC00311	Q8N616	119 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	OR4A16	Q8NH70	328 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	DTD1	Q8TEA8	209 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	CCL19	Q99731	98 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	REG4	Q9BYZ8	158 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	ARV1	Q9H2C2	271 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	MMP26	Q9NRE1	261 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	CHD6	Q8TD26	2715 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204		A0A1W2PPH5	198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	FAM157A	C9JC47	383 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	LY6L	H3BQJ8	138 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	UPK2	O00526	184 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	FGF16	O43320	207 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	MED6	O75586	246 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	JTB	O76095	146 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	ACTL6B	O94805	426 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	IGLV2-23	P01705	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	APOA2	P02652	100 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	RRAS	P10301	218 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	COX6B1	P14854	86 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	ATP6V0C	P27449	155 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	FHIT	P49789	147 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	SULT1A1	P50225	295 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	PDLIM4	P50479	330 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	PRRX1	P54821	245 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	PAX2	Q02962	417 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	HNF4G	Q14541	408 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	AANAT	Q16613	207 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	RTL8B	Q17RB0	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	FBLN7	Q53RD9	439 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	MOB3B	Q86TA1	216 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	C17orf50	Q8WW18	174 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	LHX4	Q969G2	390 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	TMEM186	Q96B77	213 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	RAB39B	Q96DA2	213 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	PERP	Q96FX8	193 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	HARBI1	Q96MB7	349 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	GINS3	Q9BRX5	216 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	HINT2	Q9BX68	163 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	NUP50	Q9UKX7	468 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	TCF19	Q9Y242	345 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	AUP1	Q9Y679	476 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	LRRK2	Q5S007	2527 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	SPG11	Q96JI7	2443 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	FBN2	P35556	2912 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	TENM4	Q6N022	2769 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204		A0A1B0GV50	99 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	C15orf61	A6NNL5	157 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	RRH	O14718	337 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	SLC25A17	O43808	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	KBTBD11	O94819	623 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	HRAS	P01112	189 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	ARG1	P05089	322 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SKAP2-204	ENST00000481204	CD24	P25063	80 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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