RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453030.5

GARNL3-210, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 536 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-210ENST00000453030 SECTM1Q8WVN6 248 aa8.73□□□□□ -1.01
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GARNL3-210ENST00000453030 A0A0J9YWU9 116 aa8.72□□□□□ -1.01
GARNL3-210ENST00000453030 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa8.72□□□□□ -1.01
GARNL3-210ENST00000453030 SSX5O60225 188 aa8.72□□□□□ -1.01
GARNL3-210ENST00000453030 HRASP01112 189 aa8.72□□□□□ -1.01
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GARNL3-210ENST00000453030 PTHLHP12272 177 aa8.71□□□□□ -1.02
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GARNL3-210ENST00000453030 RHBDL2Q9NX52 303 aa8.7□□□□□ -1.02
GARNL3-210ENST00000453030 BET1LQ9NYM9 111 aa8.7□□□□□ -1.02
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GARNL3-210ENST00000453030 OR4A5Q8NH83 315 aa8.69□□□□□ -1.02
GARNL3-210ENST00000453030 MARC2Q969Z3 335 aa8.69□□□□□ -1.02
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GARNL3-210ENST00000453030 S1PR2O95136 353 aa8.68□□□□□ -1.02
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GARNL3-210ENST00000453030 TMEM140Q9NV12 185 aa8.68□□□□□ -1.02
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GARNL3-210ENST00000453030 TRAV18A0A075B6X5 111 aa8.67□□□□□ -1.02
GARNL3-210ENST00000453030 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.67□□□□□ -1.02
GARNL3-210ENST00000453030 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa8.67□□□□□ -1.02
GARNL3-210ENST00000453030 UPK2O00526 184 aa8.67□□□□□ -1.02
GARNL3-210ENST00000453030 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP8.67□□□□□ -1.02
GARNL3-210ENST00000453030 SPRY2O43597 315 aa8.67□□□□□ -1.02
GARNL3-210ENST00000453030 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
GARNL3-210ENST00000453030 NQO2P16083 231 aa8.67□□□□□ -1.02
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