RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DEFA4P12838 97 aa15.29■□□□□ 0.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CA7P43166 264 aa15.29■□□□□ 0.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MEOX2P50222 304 aa15.29■□□□□ 0.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EFNB3Q15768 340 aa15.29■□□□□ 0.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF727A8MUV8 499 aa15.29■□□□□ 0.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYB5BO43169 146 aa15.29■□□□□ 0.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD81P60033 236 aa15.29■□□□□ 0.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C1QL4Q86Z23 238 aa15.29■□□□□ 0.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC24A4Q8NFF2 622 aa15.29■□□□□ 0.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR51B2Q9Y5P1 312 aa15.29■□□□□ 0.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCP4L1A6NKN8 68 aa15.28■□□□□ 0.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DVL1O14640 695 aa15.28■□□□□ 0.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYOD1P15172 320 aa15.28■□□□□ 0.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRNDQ9UKY0 176 aa15.28■□□□□ 0.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM90A27PA6NNH2 459 aa15.28■□□□□ 0.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 B9A039 149 aa15.28■□□□□ 0.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SOX15O60248 233 aa15.28■□□□□ 0.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NPY1RP25929 384 aa15.28■□□□□ 0.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LINC01560Q8TB33 94 aa15.28■□□□□ 0.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ENY2Q9NPA8 101 aa15.28■□□□□ 0.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KAAG1Q9UBP8 84 aa15.28■□□□□ 0.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGF2RP11717 2491 aa15.27■□□□□ 0.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa15.27■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SEC14L6B5MCN3 397 aa15.27■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UPK2O00526 184 aa15.27■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLAUP00749 431 aa15.27■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGHV2-5P01817 119 aa15.27■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LOXP28300 417 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PSMB3P49720 205 aa15.27■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa15.27■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GCSAMLQ5JQS6 135 aa15.27■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MGST2Q99735 147 aa15.27■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MANBALQ9NQG1 85 aa15.27■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa15.27■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 B4DEV8 164 aa15.26■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OPRK1P41145 380 aa15.26■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GGTLC1Q9BX51 225 aa15.26■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SIRT7Q9NRC8 400 aa15.26■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLRB1Q12918 225 aa15.26■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GATAD1Q8WUU5 269 aa15.26■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HINT2Q9BX68 163 aa15.26■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CXorf65A6NEN9 183 aa15.25■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 J3QR06 171 aa15.25■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCL21O00585 134 aa15.25■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 YIF1AO95070 293 aa15.25■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CA2P00918 260 aa15.25■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 APOA2P02652 100 aa15.25■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GRNP28799 593 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHRNB4P30926 498 aa15.25■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRCDQ00LT1 54 aa15.25■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa15.25■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C1orf159Q96HA4 380 aa15.25■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SDF2L1Q9HCN8 221 aa15.25■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NPVFQ9HCQ7 196 aa15.25■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BET1LQ9NYM9 111 aa15.25■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 H0YJW9 148 aa15.24■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KBTBD11O94819 623 aa15.24■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DLX6P56179 175 aa15.24■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR5AN1Q8NGI8 311 aa15.24■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAB1CQ92928 201 aa15.24■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLEKHA3Q9HB20 300 aa15.24■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM250H0YL14 139 aa15.24■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 S100A8P05109 93 aa15.24■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 REG1BP48304 166 aa15.24■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FABP9Q0Z7S8 132 aa15.24■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ELOBQ15370 118 aa15.24■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MIC13Q5XKP0 118 aa15.24■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C8orf31Q8N9H6 132 aa15.24■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR10X1Q8NGY0 326 aa15.24■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF596Q8TC21 504 aa15.24■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PXMP4Q9Y6I8 212 aa15.24■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OPN1MWP04001 364 aa15.23■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OPN1MW2P0DN77 364 aa15.23■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OPN1MW3P0DN78 364 aa15.23■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM155Q4W5P6 130 aa15.23■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF343Q6P1L6 599 aa15.23■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LINC00311Q8N616 119 aa15.23■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 Q8WTZ3 238 aa15.23■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HARBI1Q96MB7 349 aa15.23■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMIM7Q9BQ49 75 aa15.23■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa15.23■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AP4M1O00189 453 aa15.23■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SIAH2O43255 324 aa15.23■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM249Q2WGJ8 235 aa15.23■□□□□ 0.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM71F2Q6NXP2 309 aa15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms