RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 OR4B1Q8NGF8 309 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 VPS25Q9BRG1 176 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 NKX2-8O15522 239 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 HLA-DQA1P01909 254 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 RND2P52198 227 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 CCL8P80075 99 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 IL36BQ9NZH7 164 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 CADP27708 2225 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 IFNL4K9M1U5 179 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 TCF21O43680 179 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 IGHV1-2P23083 117 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 ETFRF1Q6IPR1 90 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 WDR83OSQ9Y284 106 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 IGFBP2P18065 325 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 HTR1DP28221 377 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 ARL3P36405 182 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF585BQ52M93 769 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 DERL1Q9BUN8 251 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 CECR9P0C854 216 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 CSN1S1P47710 185 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 AARDQ4LEZ3 155 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 IQCF6A8MYZ5 107 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 IGHV3-48P01763 117 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 TNXAQ16473 311 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM108Q6UXF1 575 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 C11orf42Q8N5U0 333 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 LTBP2Q14767 1821 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa13□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 CD82P27701 267 aa13□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 LINC00205P59089 165 aa13□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 COLCA1Q6ZS62 124 aa13□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 ATOH7Q8N100 152 aa13□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 DEFB124Q8NES8 71 aa13□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 OCC1Q8TAD7 63 aa13□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 PRDM6Q9NQX0 595 aa13□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 APC2O95996 2303 aa13□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 PKDREJQ9NTG1 2253 aa13□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 SERF1AO75920 110 aa13□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 P01737 135 aa13□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 C8orf88P0DMB2 117 aa13□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 ADMP35318 185 aa13□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF137PP52743 207 aa13□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 LYZP61626 148 aa13□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 FA2HQ7L5A8 372 aa13□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa13□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 OR9G9P0C7N8 305 aa13□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 VWA1Q6PCB0 445 aa13□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 GCSAMQ8N6F7 178 aa13□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 SGK494Q96LW2 274 aa13□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 ABCA1O95477 2261 aa13□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 GNB2P62879 340 aa13□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 FAM201AQ5SY85 155 aa13□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 Q6P435 159 aa13□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 LINC01551Q86U37 167 aa13□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa13□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 CRIM1Q9NZV1 1036 aa13□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 PRR33A8MZF0 331 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 GZMBP10144 247 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 ACP1P24666 158 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF146Q15072 292 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 COL8A1P27658 744 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF726P1Q15940 193 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 DTX1Q86Y01 620 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 IL18BPO95998 194 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF664Q8N3J9 261 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 C9orf172C9J069 976 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM11P17152 192 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM256Q8N2U0 113 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 UQCR10Q9UDW1 63 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 ISLRO14498 428 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 OR4A47Q6IF82 309 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 CDPF1Q6NVV7 123 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 WDR82Q6UXN9 313 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 MIR17HGQ75NE6 70 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM105Q8N8V8 129 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 WDR31Q8NA23 367 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM106BQ9NUM4 274 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 FAM157AC9JC47 383 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 SIAH2O43255 324 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 IGKV1-39P01597 117 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 IGKV1D-39P04432 117 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 RPL8P62917 257 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 GP6Q9HCN6 339 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 OR4A8P0C604 315 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 CD99P14209 185 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 FOXF2Q12947 444 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 CBY3A6NI87 242 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 RBPJQ06330 500 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRU-201ENST00000345512 GBGT1Q8N5D6 347 aa12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.3 ms