RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264389.6

COPS4-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS4, Length 1,744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4-201ENST00000264389 OR4C12Q96R67 309 aa6.7□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 HINT2Q9BX68 163 aa6.7□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.7□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.7□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.7□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.7□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 HILPDAQ9Y5L2 63 aa6.7□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa6.7□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 TNCP24821 2201 aa6.7□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 OOSP1A8MZH6 123 aa6.69□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 TIMM23O14925 209 aa6.69□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 FBXO24O75426 580 aa6.69□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 IFNA10P01566 189 aa6.69□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 OR8U8P0C7N1 319 aa6.69□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 MYOD1P15172 320 aa6.69□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 UBE2E1P51965 193 aa6.69□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 SLC38A11Q08AI6 406 aa6.69□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.69□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.69□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.69□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 OR5B3Q8NH48 314 aa6.69□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 GINS3Q9BRX5 216 aa6.69□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 COMMD5Q9GZQ3 224 aa6.69□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 VENTXO95231 258 aa6.68□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 IFNA5P01569 189 aa6.68□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 OPN1MWP04001 364 aa6.68□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 MSMBP08118 114 aa6.68□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 NMBP08949 121 aa6.68□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 OPN1MW2P0DN77 364 aa6.68□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 OPN1MW3P0DN78 364 aa6.68□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 CD1BP29016 333 aa6.68□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 RAB11AP62491 216 aa6.68□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 SSX2Q16385 188 aa6.68□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 HAPLN4Q86UW8 402 aa6.68□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 SLC24A4Q8NFF2 622 aa6.68□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 OR10P1Q8NGE3 313 aa6.68□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.68□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 RNF141Q8WVD5 230 aa6.68□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 CFHR4Q92496 578 aa6.68□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 ARV1Q9H2C2 271 aa6.68□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 CHD6Q8TD26 2715 aa6.68□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 C15orf62A8K5M9 175 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 B4DSR2 109 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 NPFFO15130 113 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 IGKV1D-33P01593 117 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 IGKV1-33P01594 117 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 SEC11BP0C7V7 166 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 NPY1RP25929 384 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 CNTFRP26992 372 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 SAA4P35542 130 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 F2RL1P55085 397 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 PAX8Q06710 450 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 ARL16Q0P5N6 197 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 HES1Q14469 280 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 PLGLAQ15195 96 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 PSG5Q15238 335 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 MMDQ15546 238 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 Q5PR19 223 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 MMD2Q8IY49 270 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 TEX45Q8NA69 505 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 RITA1Q96K30 269 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 CXorf58Q96LI9 332 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 RNF5Q99942 180 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 TMEM147Q9BVK8 224 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 A0A1W2PN81 502 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 LINC00862A6NCI5 91 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 PMS2P5A8MQ11 134 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 NBR2O15453 112 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 ACTL6BO94805 426 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 MOSP00540 346 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 SPP1P10451 314 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 PAX6P26367 422 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 ATP6V0CP27449 155 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 CHRNA7P36544 502 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 ATP6V1FQ16864 119 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 COMMD7Q86VX2 200 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 KIAA1456Q9P272 454 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 AUP1Q9Y679 476 aa6.67□□□□□ -1.34
COPS4-201ENST00000264389 MED13LQ71F56 2210 aa6.66□□□□□ -1.34
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