RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000073961.7

Ptpre-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptpre, Length 5,410 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Defb5Q9EPV9 64 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Tmem9bQ9JJR8 199 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Cst7O89098 144 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Defb21Q8C5Z4 100 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 DapQ91XC8 102 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 A6H6Q4 206 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Prss12O08762 761 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Rab33bO35963 229 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Siva1O54926 175 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Pcbp4P57724 403 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 SowahbQ8BZW2 760 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Ear10Q923L6 156 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Hspb9Q9DAM3 168 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Olfr1335B2RVY8 335 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 St8sia5P70126 412 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 UcnP81615 122 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 OacylQ8BML2 685 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Adh4Q9QYY9 377 aa15.38■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Zfp931A2AHM2 298 aa15.37■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Wnt1P04426 370 aa15.37■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Tmem251Q8BH26 163 aa15.37■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Lhfpl6Q8BM86 200 aa15.37■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Olfr493Q8VEW5 314 aa15.37■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 1700025C18RikA2A580 89 aa15.37■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Gm15292L7N231 93 aa15.37■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Fabp4P04117 132 aa15.37■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Ly6fP35460 134 aa15.37■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Dhrs13Q5SS80 376 aa15.37■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Megf9Q8BH27 600 aa15.37■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Lrrc26Q91W20 331 aa15.37■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Gm28171A0A087WQ19 227 aa15.37■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Vma21-psA0A140T8R2 101 aa15.37■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Lgals9O08573 353 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Il22ra1Q80XZ4 581 aa15.37■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Nfam1Q8R4V1 264 aa15.37■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 H1fooQ8VIK3 304 aa15.37■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Gpx4Q91XR9 253 aa15.37■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Dok5Q91ZM9 306 aa15.37■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Hcfc1r1Q9CYQ5 120 aa15.37■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Lysmd1Q9D0E3 226 aa15.37■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Sh2d2aQ9QXK9 374 aa15.37■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Vsig10l2A0A140LHF2 776 aa15.37■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Cldn34c3J3QJW5 233 aa15.37■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Gm10666K7N6B8 321 aa15.37■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Mdga2P60755 949 aa15.37■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Znf768Q8R0T2 568 aa15.37■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Olfr494Q8VG07 314 aa15.37■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Igkv12-44A0A140T8M2 115 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 SpxD3Z752 116 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 P01629 112 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Ube2l3P68037 154 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Lims1Q99JW4 325 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Trbv5A0A0B4J1G9 113 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Onecut1O08755 465 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Pitx3O35160 302 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Fabp6P51162 128 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Tmem52bQ0VBF2 186 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Nanos1Q80WY3 267 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Gpr84Q8CIM5 396 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 ManfQ9CXI5 179 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Vmn1r61W4VSP5 300 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 SiglechB7ZMQ6 332 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 P18524 117 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Klk1b26P36369 261 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Msl2Q69ZF8 577 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 F12Q80YC5 597 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 D330020A13RikQ8C799 211 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Olfr495Q8VF12 330 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Q9CR34 168 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Rarres2Q9DD06 162 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 FAM186AQ9D9R9 1790 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Trav12-2A0N8N6 114 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Fam160a2Q3U2I3 975 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Olfr1408Q8VG32 310 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Fbxo25Q9D2Y6 357 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Tnfsf14Q9QYH9 239 aa15.36■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Cldn34c2J3QNM1 233 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Spam1P48794 512 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 FusP56959 518 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Cldn34c1Q8K193 234 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Tmem88Q9D0N8 159 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Eaf1Q9D4C5 268 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Smdt1Q9DB10 107 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 ClmQ7TSN2 230 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Henmt1Q8CAE2 395 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Ndfip1Q8R0W6 221 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Olfr206Q8VGP9 306 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 UmodQ91X17 642 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Gkn3Q9D0T7 191 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Kcne4Q9WTW3 170 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Znf318Q99PP2 2237 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Prob1A0A087WR45 1010 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Gm28044L7N1X0 119 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Sfxn4Q925N1 313 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Gm15440D3Z3P4 90 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Olfr1220F7BL62 311 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Klf9O35739 244 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Mmp9P41245 730 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Mettl4Q3U034 471 aa15.35■□□□□ 0.05
Ptpre-201ENSMUST00000073961 PnlipQ6P8U6 465 aa15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.1 ms