RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hsd17b6Q9R092 317 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kif26aQ52KG5 1881 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Igkv9-123A0A140T8N8 117 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrrc29A0A1B0GQY9 621 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm20821J3QPJ2 227 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Chrna7P49582 502 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PilraQ2YFS3 302 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ArsjQ8BM89 598 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SpartQ8R1X6 671 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1279Q8VF38 313 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Abhd14aQ922Q6 247 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ube2v2Q9D2M8 145 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sval1Q9D2X6 151 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc2a8Q9JIF3 477 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm3550W4VSN7 160 aa11.1□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm26965M0QWH4 86 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CebpbP28033 296 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PpicP30412 212 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HhexP43120 271 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ier3P46694 153 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rpl31P62900 125 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MffQ6PCP5 291 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prss33Q80WM7 277 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klre1Q8CJC7 226 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr790Q8VGJ3 322 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rab40cQ8VHQ4 281 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Asb5Q9D1A4 329 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr157Q9QZ20 318 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 1700025C18RikA2A580 89 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Efnb2P52800 336 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ClcP97400 68 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kcnip4Q6PHZ8 250 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp1r3cQ7TMB3 317 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ankrd46Q8BTZ5 228 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prss35Q8C0F9 409 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AspaQ8R3P0 312 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1238Q8VG59 315 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Isg20Q9JL16 300 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prss30Q9QYZ9 310 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MpdzQ8VBX6 2055 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kif26bQ7TNC6 2112 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pwwp2bE9Q9M8 600 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r113G3UWI8 307 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Serf1O88892 62 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lyl1P27792 278 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sap30lQ5SQF8 182 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nup37Q9CWU9 326 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rab32Q9CZE3 223 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ssmem1Q9D9Y8 244 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ttc32Q9DAC7 148 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Eif3fQ9DCH4 361 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 BC024063A0A1W2P7G7 749 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tnfaip6O08859 275 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fgf12P61329 243 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem171Q4KL18 322 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp948Q6DFU8 667 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1472Q7TQQ9 314 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 LmlnQ8BMN4 681 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdc34Q8CFI2 235 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1242Q8VGM6 306 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr362Q8VGV7 317 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ndufa2Q9CQ75 99 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cox20Q9D7J4 117 aa11.09□□□□□ -0.63
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm4779A0A1B0GR91 561 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr39E9PVX1 319 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 B4galt1P15535 399 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Polr2gP62488 172 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lclat1Q3UN02 376 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 6430531B16RikQ3V2J1 307 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 C030005K15RikQ8BQN9 115 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Harbi1Q8BR93 349 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rcc1lQ9CYF5 461 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mpped2Q9CZJ0 294 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nat8Q9JIY7 227 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AtrxQ61687 2476 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1326-ps1A0A140T8J7 311 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slco5a1E9PVD9 850 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccl3P10855 92 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 H1f0P10922 194 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P18532 116 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr147Q60886 317 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1474Q7TQQ8 314 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc35e1Q8CD26 409 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr828Q8VFM8 312 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1408Q8VG32 310 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cacng8Q8VHW2 423 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Btbd17Q9DB72 478 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trav5-4A0A075B652 114 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fcrl6A1YIY0 268 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrp3E9Q1T6 790 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr555E9Q547 315 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 BokO35425 213 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P06344 263 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ArsbP50429 534 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mfsd4b3Q3UN21 355 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gpank1Q61858 372 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q8CDS7 251 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dhrs7cQ8CHS7 311 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm10762Q9CZN6 115 aa11.08□□□□□ -0.64
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sh2d2aQ9QXK9 374 aa11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 42.3 ms