Protein–RNA interactions for Protein: O88892

Serf1, Small EDRK-rich factor 1, mousemouse

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Length 62 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serf1O88892 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Serf1O88892 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Serf1O88892 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Serf1O88892 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Serf1O88892 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Serf1O88892 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Serf1O88892 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Serf1O88892 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Serf1O88892 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Serf1O88892 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Serf1O88892 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Serf1O88892 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Serf1O88892 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Serf1O88892 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Serf1O88892 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Serf1O88892 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Serf1O88892 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Serf1O88892 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Serf1O88892 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Serf1O88892 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Serf1O88892 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Serf1O88892 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Serf1O88892 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Serf1O88892 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Serf1O88892 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Serf1O88892 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Serf1O88892 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Serf1O88892 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Serf1O88892 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Serf1O88892 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Serf1O88892 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Serf1O88892 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Serf1O88892 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Serf1O88892 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Serf1O88892 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Serf1O88892 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Serf1O88892 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Serf1O88892 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Serf1O88892 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Serf1O88892 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Serf1O88892 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Serf1O88892 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Serf1O88892 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Serf1O88892 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Serf1O88892 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Serf1O88892 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Serf1O88892 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Serf1O88892 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Serf1O88892 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Serf1O88892 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Serf1O88892 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Serf1O88892 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Serf1O88892 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Serf1O88892 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Serf1O88892 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Serf1O88892 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Serf1O88892 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Serf1O88892 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Serf1O88892 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Serf1O88892 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Serf1O88892 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Serf1O88892 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Serf1O88892 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Serf1O88892 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Serf1O88892 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Serf1O88892 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Serf1O88892 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Serf1O88892 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Serf1O88892 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Serf1O88892 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Serf1O88892 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Serf1O88892 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Serf1O88892 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Serf1O88892 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Serf1O88892 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Serf1O88892 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Serf1O88892 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Serf1O88892 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Serf1O88892 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Serf1O88892 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Serf1O88892 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Serf1O88892 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Serf1O88892 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Serf1O88892 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Serf1O88892 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Serf1O88892 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Serf1O88892 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Serf1O88892 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Serf1O88892 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Serf1O88892 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Serf1O88892 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Serf1O88892 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Serf1O88892 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Serf1O88892 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Serf1O88892 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Serf1O88892 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Serf1O88892 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Serf1O88892 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Serf1O88892 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Serf1O88892 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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