RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 SLC35D1Q9NTN3 355 aa3.35□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 KIAA1456Q9P272 454 aa3.35□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF221Q9UK13 617 aa3.35□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 SPATA2Q9UM82 520 aa3.35□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 WASHC3Q9Y3C0 194 aa3.35□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 MMP24Q9Y5R2 645 aa3.35□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 S4R3C0 116 aa3.35□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 OOSP1A8MZH6 123 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 FCN1O00602 326 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 RRHO14718 337 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 RAB29O14966 203 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 RGS5O15539 181 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 TXNL1O43396 289 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 LANCL1O43813 399 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 YPEL1O60688 119 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 FCGR3BO75015 233 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 CA11O75493 328 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 PRH1P02810 166 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 RLN1P04808 185 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 REG1AP05451 166 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 TFAP2AP05549 437 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 CT45A6P0DMU7 189 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 CT45A5P0DMU8 189 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 CT45A7P0DMV0 189 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 VDAC1P21796 283 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 AADACP22760 399 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 HLA-DMAP28067 261 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 PSMD7P51665 324 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 DYNLT3P51808 116 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 TPPP2P59282 170 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 HERV-K104P61576 105 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 HTD2P86397 168 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 KIR2DS1Q14954 304 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 TNXAQ16473 311 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 AANATQ16613 207 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF260Q3ZCT1 412 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 C16orf82Q7Z2V1 217 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 GPR141Q7Z602 305 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 LAX1Q8IWV1 398 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 LINC00311Q8N616 119 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 Q8N6K4 173 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 NRACQ8N912 160 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 BEST4Q8NFU0 473 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 OR4A4PQ8NGN8 299 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 OR13F1Q8NGS4 319 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 OR51H1Q8NH63 302 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 SNAPC3Q92966 411 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 YPEL2Q96QA6 119 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 PHB2Q99623 299 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 CABLES2Q9BTV7 478 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 TM2D2Q9BX73 214 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 FXYD6Q9H0Q3 95 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 DCSTAMPQ9H295 470 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 LINC00574Q9H8X3 128 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 GNB4Q9HAV0 340 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 RAB9BQ9NP90 201 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 CCL28Q9NRJ3 127 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 NECAP2Q9NVZ3 263 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 SDHAF2Q9NX18 166 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 EHFQ9NZC4 300 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 PEMTQ9UBM1 199 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 ETV7Q9Y603 341 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa3.34□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 COL7A1Q02388 2944 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 TRAV41A0A0B4J266 112 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 GAGE12JA6NER3 117 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 OR5H14A6NHG9 310 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 SULT1C2O00338 296 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 FGF16O43320 207 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 RAMP3O60896 148 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 NOL3O60936 208 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 GABARAPO95166 117 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 CNIH1O95406 144 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 IGHV3-23P01764 117 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 IGHG2P01859 326 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 ELK1P19419 428 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 CD1BP29016 333 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 FCGR2CP31995 323 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF137PP52743 207 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 OR2B8PP59922 312 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 RPL30P62888 115 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 SLC35B1P78383 322 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 CBX3Q13185 183 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 PSG5Q15238 335 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 C5orf64Q2M2E5 130 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM30BQ3MIR4 351 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 PHLDA2Q53GA4 152 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.6 ms