RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 C18orf65Q6ZTR6 163 aa4.41□□□□□ -1.7
TRDN-205ENST00000546248 FAM216BQ8N7L0 139 aa4.41□□□□□ -1.7
TRDN-205ENST00000546248 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa4.41□□□□□ -1.7
TRDN-205ENST00000546248 UBAC2Q8NBM4 344 aa4.41□□□□□ -1.7
TRDN-205ENST00000546248 CT45A3Q8NHU0 189 aa4.41□□□□□ -1.7
TRDN-205ENST00000546248 LRRC20Q8TCA0 184 aa4.41□□□□□ -1.7
TRDN-205ENST00000546248 MARC2Q969Z3 335 aa4.41□□□□□ -1.7
TRDN-205ENST00000546248 C14orf79Q96F83 325 aa4.41□□□□□ -1.7
TRDN-205ENST00000546248 SMIM8Q96KF7 97 aa4.41□□□□□ -1.7
TRDN-205ENST00000546248 GINS3Q9BRX5 216 aa4.41□□□□□ -1.7
TRDN-205ENST00000546248 SLC25A33Q9BSK2 321 aa4.41□□□□□ -1.7
TRDN-205ENST00000546248 LINC00574Q9H8X3 128 aa4.41□□□□□ -1.7
TRDN-205ENST00000546248 NGBQ9NPG2 151 aa4.41□□□□□ -1.7
TRDN-205ENST00000546248 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa4.41□□□□□ -1.7
TRDN-205ENST00000546248 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
TRDN-205ENST00000546248 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
TRDN-205ENST00000546248 CALYQ9NYX4 217 aa4.41□□□□□ -1.7
TRDN-205ENST00000546248 JPT1Q9UK76 154 aa4.41□□□□□ -1.7
TRDN-205ENST00000546248 PSG11Q9UQ72 335 aa4.41□□□□□ -1.7
TRDN-205ENST00000546248 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa4.41□□□□□ -1.7
TRDN-205ENST00000546248 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa4.41□□□□□ -1.7
TRDN-205ENST00000546248 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.7
TRDN-205ENST00000546248 PPIAL4EA0A075B759 164 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 RAB19A4D1S5 217 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 PRSS47A8MTI9 375 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 RNF212BA8MTL3 300 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 PPIAL4DF5H284 164 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 TOR1AO14656 332 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 TXNL1O43396 289 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 SYNGR2O43760 224 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 SSSCA1O60232 199 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 S1PR2O95136 353 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 CLDN14O95500 239 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 IGHV3-7P01780 117 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 SEC11BP0C7V7 166 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 PPIAL4FP0DN26 164 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 SPP1P10451 314 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 PLA2G2AP14555 144 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 OMGP23515 440 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 DYNLT3P51808 116 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 EDDM3BP56851 147 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 ARL16Q0P5N6 197 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 LY6DQ14210 128 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 RPL39P5Q59GN2 51 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 SPAG16Q8N0X2 631 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 ZNF439Q8NDP4 499 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 BPIFCQ8NFQ6 507 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 LYPD6BQ8NI32 183 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 FAM216AQ8WUB2 273 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 ZNF251Q9BRH9 671 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 TMEM204Q9BSN7 226 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 SLC25A31Q9H0C2 315 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 IFI27L2Q9H2X8 130 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 TMEM106BQ9NUM4 274 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 COA4Q9NYJ1 87 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 CLN8Q9UBY8 286 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 CACNG5Q9UF02 275 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 CACFD1Q9UGQ2 172 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 PPIAL4AQ9Y536 164 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 MMP24Q9Y5R2 645 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 RFNGQ9Y644 331 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 CHD6Q8TD26 2715 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 DOCK7Q96N67 2140 aa4.4□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 EPG5Q9HCE0 2579 aa4.39□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa4.39□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa4.39□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 A0A1W2PPE3 182 aa4.39□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 PMS2P5A8MQ11 134 aa4.39□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 KRBOX1C9JBD0 128 aa4.39□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 FAM90A26D6RGX4 464 aa4.39□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 WRBO00258 174 aa4.39□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 VCYO14598 125 aa4.39□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 SCO1O75880 301 aa4.39□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 KRASP01116 189 aa4.39□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 PRSS2P07478 247 aa4.39□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 OR9G9P0C7N8 305 aa4.39□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 DANCRP0C864 163 aa4.39□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 IAPPP10997 89 aa4.39□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 IRF2P14316 349 aa4.39□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 ZP3P21754 424 aa4.39□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 COL8A2P25067 703 aa4.39□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 G6PCP35575 357 aa4.39□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 CAV2P51636 162 aa4.39□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 TAS2R30P59541 319 aa4.39□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 TFF3Q07654 80 aa4.39□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 PJVKQ0ZLH3 352 aa4.39□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 CATR1Q13166 79 aa4.39□□□□□ -1.71
TRDN-205ENST00000546248 ZNF273Q14593 569 aa4.39□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms