RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512392.5

CHD1-208, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene CHD1, Length 1,968 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHD1-208	ENST00000512392	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	DYSF	O75923	2080 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	PCM1	Q15154	2024 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	PEX7	O00628	323 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	DPM2	O94777	84 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	HLA-DQB1	P01920	261 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	MDP1	Q86V88	176 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	MGLL	Q99685	303 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CHD1-208	ENST00000512392	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392		C9JQL5	133 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	NPFF	O15130	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	DEDD	O75618	318 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	BGLAP	P02818	100 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	LINC00303	Q3SY05	128 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF695	Q8IW36	515 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	TMEM106A	Q96A25	262 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	CMBL	Q96DG6	245 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF799	Q96GE5	643 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	AICDA	Q9GZX7	198 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	SYNJ1	O43426	1573 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392		A8MWP6	167 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	UCHL1	P09936	223 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	DSCR9	P59020	149 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	CXCL6	P80162	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	CDK6	Q00534	326 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	RTL8B	Q17RB0	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	CROCCP2	Q86T23	111 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	PRR15	Q8IV56	129 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	AP1S3	Q96PC3	154 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	OR2A5	Q96R48	311 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF492	Q9P255	531 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	NAT8	Q9UHE5	227 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	DPRX	A6NFQ7	191 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	TMEM212	A6NML5	194 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392		A8MXK9	166 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	INPP1	P49441	399 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	NEUROG1	Q92886	237 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	FAM104A	Q969W3	186 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	ODAM	A1E959	279 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	TRGC2	P03986	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF728	P0DKX0	622 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	PDGFRL	Q15198	375 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	DCANP1	Q8TF63	244 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	DERL3	Q96Q80	235 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	IGLV3-27	P01718	113 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	SEC11B	P0C7V7	166 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	CAV1	Q03135	178 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CHD1-208	ENST00000512392	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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