RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493853.1

RBM39-238, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 4

Gene RBM39, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-238	ENST00000493853	FAM223B	A6NKX1	122 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	MFNG	O00587	321 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	FCGR3B	O75015	233 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	IFNA6	P05013	189 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	CRYGB	P07316	175 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	OR9G9	P0C7N8	305 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	CD36	P16671	472 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	GAL	P22466	123 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	PSMB9	P28065	219 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	GNG2	P59768	71 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	RHOG	P84095	191 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	SSX1	Q16384	188 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	PRSS8	Q16651	343 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	CASC10	Q5T4H9	136 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	KCTD9	Q7L273	389 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	MMD2	Q8IY49	270 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853		Q9H521	79 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	RAB26	Q9ULW5	256 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	SSR3	Q9UNL2	185 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	COL7A1	Q02388	2944 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	LINC00473	A8K010	186 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	AIRE	O43918	545 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	BRI3	O95415	125 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	SCAND1	P57086	179 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	DEFA5	Q01523	94 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	CDK10	Q15131	360 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	CT83	Q5H943	113 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	FAM209B	Q5JX69	171 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	HACD4	Q5VWC8	232 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	CNIH2	Q6PI25	160 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853		Q6ZS49	121 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	TPRA1	Q86W33	373 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853		Q8N402	240 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	ISOC1	Q96CN7	298 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	SPATA2	Q9UM82	520 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	TENM3	Q9P273	2699 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	TMEM235	A6NFC5	223 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853		A8MZ25	164 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	OR2A4	O95047	310 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	DHFR	P00374	187 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	HRAS	P01112	189 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	TRBV12-3	P01733	135 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	HLA-DQB1	P01920	261 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	PRH1	P02810	166 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	DEFA4	P12838	97 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	ARPC4	P59998	168 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	GABARAPL2	P60520	117 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	DYRK1A	Q13627	763 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853		Q6ZRM9	215 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	NECAP1	Q8NC96	275 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	OR4S2	Q8NH73	311 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	DDB2	Q92466	427 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	FCGR1B	Q92637	280 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	C5orf30	Q96GV9	206 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	OR51E2	Q9H255	320 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	OR2J3	O76001	311 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	TPPP	O94811	219 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	CSN3	P07498	182 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM39-238	ENST00000493853	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49

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