RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	EDDM3B	P56851	147 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	RAB2A	P61019	212 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	HNF4G	Q14541	408 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF266	Q14584	549 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	PEA15	Q15121	130 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	AARD	Q4LEZ3	155 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	SSX9	Q7RTT3	188 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	MUC15	Q8N387	334 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF383	Q8NA42	475 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	CCL19	Q99731	98 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	KIAA1456	Q9P272	454 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	IL19	Q9UHD0	177 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	JPT1	Q9UK76	154 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	KPTN	Q9Y664	436 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		4.74	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	TNC	P24821	2201 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	LRRK2	Q5S007	2527 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A1W2PPE2	198 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A1W2PPH5	198 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	C17orf100	A8MU93	164 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF727	A8MUV8	499 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730		B9A039	149 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	UMAD1	C9J7I0	102 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	ITGB1BP1	O14713	200 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	RRH	O14718	337 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	NDUFS7	O75251	213 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	DFFB	O76075	338 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	ARG1	P05089	322 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	OR8U8	P0C7N1	319 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	DEFA4	P12838	97 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	SELENOV	P59797	346 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	CCL8	P80075	99 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	MZT1	Q08AG7	82 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	CATR1	Q13166	79 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	VWC2	Q2TAL6	325 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	LCN15	Q6UWW0	184 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	C1QL4	Q86Z23	238 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	DTD1	Q8TEA8	209 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	CORO2A	Q92828	525 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	NINJ1	Q92982	152 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	PERP	Q96FX8	193 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	GNG12	Q9UBI6	72 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	GAB2	Q9UQC2	676 aa		4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.72	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM178B	H3BS89	294 aa		4.72	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	OVOL3	O00110	214 aa		4.72	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	NDUFA2	O43678	99 aa		4.72	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	LY6H	O94772	140 aa		4.72	□□□□□ -1.65
C4BPB-208	ENST00000492730	YIF1A	O95070	293 aa		4.72	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms