RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 C12orf49Q9H741 205 aa11.27□□□□□ -0.6
SH3BP1-206ENST00000469947 IL36BQ9NZH7 164 aa11.27□□□□□ -0.6
SH3BP1-206ENST00000469947 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
SH3BP1-206ENST00000469947 FOXH1O75593 365 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 IGHV3-13P01766 116 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 IGHV3-7P01780 117 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 PLP2Q04941 152 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 CFAP161Q6P656 301 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
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SH3BP1-206ENST00000469947 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 MPC1Q9Y5U8 109 aa11.27□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 MMP23AO75900 390 aa11.26□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 SSTR5P35346 364 aa11.26□□□□□ -0.61
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SH3BP1-206ENST00000469947 MMD2Q8IY49 270 aa11.26□□□□□ -0.61
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SH3BP1-206ENST00000469947 MS4A5Q9H3V2 200 aa11.26□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 KCNIP1Q9NZI2 227 aa11.26□□□□□ -0.61
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SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF826PQ6ZT77 177 aa11.26□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM19A2Q8N3H0 131 aa11.26□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 ORAOV1Q8WV07 137 aa11.26□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 STARD4Q96DR4 205 aa11.26□□□□□ -0.61
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SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF586Q9NXT0 402 aa11.26□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 NAT8BQ9UHF3 227 aa11.26□□□□□ -0.61
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SH3BP1-206ENST00000469947 FOLR3P41439 243 aa11.25□□□□□ -0.61
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SH3BP1-206ENST00000469947 TXNDC17Q9BRA2 123 aa11.25□□□□□ -0.61
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SH3BP1-206ENST00000469947 PRR14LQ5THK1 2151 aa11.25□□□□□ -0.61
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SH3BP1-206ENST00000469947 GGTLC1Q9BX51 225 aa11.25□□□□□ -0.61
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SH3BP1-206ENST00000469947 STAG3L2P0CL84 134 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 STAG3L3P0CL85 134 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 IGLC2P0DOY2 106 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 IGLC3P0DOY3 106 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
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SH3BP1-206ENST00000469947 UQCR10Q9UDW1 63 aa11.24□□□□□ -0.61
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SH3BP1-206ENST00000469947 ACTL6BO94805 426 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 NTF3P20783 257 aa11.24□□□□□ -0.61
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SH3BP1-206ENST00000469947 PRR31Q5SQ13 230 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 LCN12Q6JVE5 192 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 Q6ZR03 302 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 RTL8AQ9BWD3 113 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa11.24□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 NKX6-3A6NJ46 265 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 K7ESF4 209 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 CXorf1O96002 111 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 GCHFRP30047 84 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 SIT1Q9Y3P8 196 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 TRAV3A0A0B4J244 114 aa11.23□□□□□ -0.61
SH3BP1-206ENST00000469947 FCGR3BO75015 233 aa11.23□□□□□ -0.61
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