RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468638.1

INPP4A-208, Transcript of inositol polyphosphate-4-phosphatase type I A, human

TSL 3

Gene INPP4A, Length 635 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
INPP4A-208	ENST00000468638	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
INPP4A-208	ENST00000468638	ACTL6B	O94805	426 aa		13.77	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	NQO2	P16083	231 aa		13.77	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	LPAR6	P43657	344 aa		13.77	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	PIGP	P57054	158 aa		13.77	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	RND3	P61587	244 aa		13.77	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		13.77	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	OR4A47	Q6IF82	309 aa		13.77	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		13.77	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		13.77	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		13.77	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		13.77	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		13.77	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		13.77	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	OR4F4	Q96R69	305 aa		13.77	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	PRRT1	Q99946	306 aa		13.77	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		13.77	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	ZFP57	Q9NU63	452 aa		13.77	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	MCUB	Q9NWR8	336 aa		13.77	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		13.76	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	NUDT19	A8MXV4	375 aa		13.76	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	MPPED1	O15442	326 aa		13.76	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	SOX15	O60248	233 aa		13.76	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	IGLV1-40	P01703	118 aa		13.76	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	PF4V1	P10720	104 aa		13.76	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	RPA2	P15927	270 aa		13.76	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	ECI1	P42126	302 aa		13.76	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	AP3S2	P59780	193 aa		13.76	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	POU2AF1	Q16633	256 aa		13.76	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		13.76	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	ZNF585B	Q52M93	769 aa		13.76	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		13.76	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	TMEM65	Q6PI78	240 aa		13.76	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		13.76	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		13.76	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	PHB2	Q99623	299 aa		13.76	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	KLK15	Q9H2R5	256 aa		13.76	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		13.76	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		13.76	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	BET1L	Q9NYM9	111 aa		13.76	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	APELA	P0DMC3	54 aa		13.75	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	ERVK-16	P61578	105 aa		13.75	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		13.75	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	OR4A5	Q8NH83	315 aa		13.75	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		13.75	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	TMEM140	Q9NV12	185 aa		13.75	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	COPZ2	Q9P299	210 aa		13.75	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		13.75	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	MSGN1	A6NI15	193 aa		13.74	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	MARCH11	A6NNE9	402 aa		13.74	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		13.74	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		13.74	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		13.74	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		13.74	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		13.74	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		13.73	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638		H0Y980	276 aa		13.73	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	UPK2	O00526	184 aa		13.73	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	KRAS	P01116	189 aa		13.73	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	MAS1L	P35410	378 aa		13.73	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	G6PC	P35575	357 aa		13.73	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	RAB9A	P51151	201 aa		13.73	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	BAK1	Q16611	211 aa		13.73	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	TRIQK	Q629K1	86 aa		13.73	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	ZNF695	Q8IW36	515 aa		13.73	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	OR5T1	Q8NG75	326 aa		13.73	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	TMEM68	Q96MH6	324 aa		13.73	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		13.73	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		13.72	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	PF4	P02776	101 aa		13.72	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	SERPINE2	P07093	398 aa		13.72	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	MYOD1	P15172	320 aa		13.72	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	HLA-G	P17693	338 aa		13.72	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	INPP1	P49441	399 aa		13.72	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	ZNF45	Q02386	682 aa		13.72	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	MS4A10	Q96PG2	267 aa		13.72	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	TP53RK	Q96S44	253 aa		13.72	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	SPIN2A	Q99865	258 aa		13.72	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		13.72	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		13.72	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	GPR132	Q9UNW8	380 aa		13.72	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		13.71	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638		E7EUB6	86 aa		13.71	□□□□□ -0.21
INPP4A-208	ENST00000468638	IGKV1-39	P01597	117 aa		13.71	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.6 ms