RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 HCP5Q6MZN7 132 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 SFTA2Q6UW10 78 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 TCF24Q7RTU0 167 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 VSIRQ9H7M9 311 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 SPINK14Q6IE38 97 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 TMEM108Q6UXF1 575 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 OR5A1Q8NGJ0 315 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 RFNGQ9Y644 331 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 COL4A1P02462 1669 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 BTAF1O14981 1849 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 IZUMO1RA6ND01 250 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 AGFG2O95081 481 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 IGHV3-48P01763 117 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 LIFP15018 202 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 TMEM92Q6UXU6 159 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 NEUROG1Q92886 237 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 SCNM1Q9BWG6 230 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 TM2D1Q9BX74 207 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 TNFRSF19Q9NS68 423 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 C9JQL5 133 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 DLL1O00548 723 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 PRDX2P32119 198 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 TEX38Q6PEX7 206 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 ZNF788Q6ZQV5 615 aa8.35□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 ODAMA1E959 279 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 TSPAN7P41732 249 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 CKS1BP61024 79 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 RELQ04864 619 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 MDP1Q86V88 176 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 ORAOV1Q8WV07 137 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 CTHRC1Q96CG8 243 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 COX5BP10606 129 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 ZNF826PQ6ZT77 177 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 WNK3Q9BYP7 1800 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 LINC01565O15544 149 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 MPZP25189 248 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 GFRA1P56159 465 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 PROB1E7EW31 1015 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 TMEM240Q5SV17 173 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 TEX29Q8N6K0 151 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 OCC1Q8TAD7 63 aa8.34□□□□□ -1.07
HERC3-202ENST00000402738 SVILO95425 2214 aa8.34□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 MKRN2OSH3BPM6 223 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 BMI1P35226 326 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 MESP2Q0VG99 397 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 PRELID3AQ96N28 172 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 CLEC1BQ9P126 229 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 HIGD1CA8MV81 97 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 APOMO95445 188 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 MPV17L2Q567V2 206 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 MBD3L1Q8WWY6 194 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 RPL8P62917 257 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 LHX8Q68G74 356 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 LCN12Q6JVE5 192 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 PNKDQ8N490 385 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 SFXN3Q9BWM7 321 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 RTTNQ86VV8 2226 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 PRRG2O14669 202 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 IGHMP01871 453 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 ACTL10Q5JWF8 245 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 C9orf50Q5SZB4 431 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 C1orf174Q8IYL3 243 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 LRTM2Q8N967 370 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 ZPBPQ9BS86 351 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 LAMB2P55268 1798 aa8.33□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 MUC21A0A140T8X8 626 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 A0A1B0GW64 132 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 CTSBP07858 339 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 MUC21Q5SSG8 566 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 FOXC2Q99958 501 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 MS4A5Q9H3V2 200 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 IGFBP2P18065 325 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 MST1LQ2TV78 715 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 TIMM23BQ5SRD1 257 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 MIR17HGQ75NE6 70 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 ZNF714Q96N38 554 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 C19orf24Q9BVV8 132 aa8.32□□□□□ -1.08
HERC3-202ENST00000402738 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
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