RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357631.6

LRRC20-202, Transcript of leucine rich repeat containing 20, humanhuman

TSL 2

Gene LRRC20, Length 2,906 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC20-202ENST00000357631 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 HOXA5P20719 270 aa14.56□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 RPL23P62829 140 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 RPP30P78346 268 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 RHOVQ96L33 236 aa14.56□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 APC2O95996 2303 aa14.56□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 A0A1W2PPV4 95 aa14.56□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 TMEM250H0YL14 139 aa14.56□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 CGB3P0DN86 165 aa14.56□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 CGB7P0DN87 165 aa14.56□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 CD40P25942 277 aa14.56□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 RAB7AP51149 207 aa14.56□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 RTP5Q14D33 572 aa14.56□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 TMEM242Q9NWH2 141 aa14.56□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 A8MXE2 369 aa14.55□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 GFRA3O60609 400 aa14.55□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 TREML4Q6UXN2 200 aa14.55□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 FRZBQ92765 325 aa14.55□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 ZNF251Q9BRH9 671 aa14.55□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 MS4A5Q9H3V2 200 aa14.55□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 C11orf94C9JXX5 98 aa14.55□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 OPN1MWP04001 364 aa14.55□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 OPN1MW2P0DN77 364 aa14.55□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 OPN1MW3P0DN78 364 aa14.55□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 MYOD1P15172 320 aa14.55□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 CCL8P80075 99 aa14.55□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 CST9LP1Q5W188 147 aa14.55□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 DDB2Q92466 427 aa14.55□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 GAFA1Q96PS6 74 aa14.55□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 IL19Q9UHD0 177 aa14.55□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa14.55□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 MMP23AO75900 390 aa14.55□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 TRGC1P0CF51 173 aa14.55□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 MIC13Q5XKP0 118 aa14.55□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 STUMQ69YW2 141 aa14.55□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 WFDC8Q8IUA0 241 aa14.55□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 FAM57AQ8TBR7 257 aa14.55□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 CTDSP1Q9GZU7 261 aa14.55□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 ZNRD1Q9P1U0 126 aa14.55□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 TNFSF4P23510 183 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 KIR2DS2P43631 304 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 GATA4P43694 442 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 TCF15Q12870 199 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 AARDQ4LEZ3 155 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 TMEM170AQ8WVE7 144 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 SSMEM1Q8WWF3 244 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 GFI1BQ5VTD9 330 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 OR4A47Q6IF82 309 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 TCF23Q7RTU1 214 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 ZNF383Q8NA42 475 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 OR51G1Q8NGK1 321 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 ABHD5Q8WTS1 349 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 FAM222BQ8WU58 562 aa14.54□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 ATMQ13315 3056 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 IFITM10A6NMD0 228 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 H7BYZ3 331 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 IRF2P14316 349 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 NDUFB7P17568 137 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 CCKARP32238 428 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 OR52E5Q8NH55 327 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 MGST2Q99735 147 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 FABP1P07148 127 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 ATP5G3P48201 142 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 S100A12P80511 92 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 RAB9BQ9NP90 201 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 GAB2Q9UQC2 676 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 PXMP4Q9Y6I8 212 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 C15orf61A6NNL5 157 aa14.52□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 S100A2P29034 98 aa14.52□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 THBS3P49746 956 aa14.52□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 C3orf36Q3SXR2 165 aa14.52□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 ELOVL1Q9BW60 279 aa14.52□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa14.52□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 MUC6Q6W4X9 2439 aa14.52□□□□□ -0.08
LRRC20-202ENST00000357631 TMPRSS2O15393 492 aa14.52□□□□□ -0.09
LRRC20-202ENST00000357631 NPPCP23582 126 aa14.52□□□□□ -0.09
LRRC20-202ENST00000357631 OR13D1Q8NGV5 346 aa14.52□□□□□ -0.09
LRRC20-202ENST00000357631 GGTLC1Q9BX51 225 aa14.52□□□□□ -0.09
LRRC20-202ENST00000357631 ENY2Q9NPA8 101 aa14.52□□□□□ -0.09
LRRC20-202ENST00000357631 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa14.52□□□□□ -0.09
LRRC20-202ENST00000357631 MIOXQ9UGB7 285 aa14.52□□□□□ -0.09
LRRC20-202ENST00000357631 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa14.52□□□□□ -0.09
LRRC20-202ENST00000357631 LY86O95711 162 aa14.52□□□□□ -0.09
LRRC20-202ENST00000357631 GALR1P47211 349 aa14.52□□□□□ -0.09
LRRC20-202ENST00000357631 OR5B12Q96R08 314 aa14.52□□□□□ -0.09
LRRC20-202ENST00000357631 TMEM204Q9BSN7 226 aa14.52□□□□□ -0.09
LRRC20-202ENST00000357631 GPR61Q9BZJ8 451 aa14.52□□□□□ -0.09
LRRC20-202ENST00000357631 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LRRC20-202ENST00000357631 KRTCAP3Q53RY4 240 aa14.51□□□□□ -0.09
LRRC20-202ENST00000357631 ZNF788Q6ZQV5 615 aa14.51□□□□□ -0.09
LRRC20-202ENST00000357631 FAM216AQ8WUB2 273 aa14.51□□□□□ -0.09
LRRC20-202ENST00000357631 DIRC2Q96SL1 478 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms