RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM147Q9BVK8 224 aa21.83■■□□□ 1.09
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HOXD8-201ENST00000313173 GNB2P62879 340 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD8-201ENST00000313173 RPP30P78346 268 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
HOXD8-201ENST00000313173 NABP2Q9BQ15 211 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD8-201ENST00000313173 HIPK2Q9H2X6 1198 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD8-201ENST00000313173 TREM1Q9NP99 234 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD8-201ENST00000313173 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
HOXD8-201ENST00000313173 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD8-201ENST00000313173 IL3RAP26951 378 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD8-201ENST00000313173 REG1BP48304 166 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD8-201ENST00000313173 DPPA3Q6W0C5 159 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD8-201ENST00000313173 RSG1Q9BU20 258 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD8-201ENST00000313173 PRNDQ9UKY0 176 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD8-201ENST00000313173 FBXO7Q9Y3I1 522 aa21.82■■□□□ 1.08
HOXD8-201ENST00000313173 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
HOXD8-201ENST00000313173 A6NNC1 897 aa21.81■■□□□ 1.08
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HOXD8-201ENST00000313173 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM231Q9H6L2 316 aa21.81■■□□□ 1.08
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HOXD8-201ENST00000313173 UPK2O00526 184 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXD8-201ENST00000313173 SNCAP37840 140 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXD8-201ENST00000313173 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM177Q53S58 311 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXD8-201ENST00000313173 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
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HOXD8-201ENST00000313173 FAM96BQ9Y3D0 163 aa21.8■■□□□ 1.08
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HOXD8-201ENST00000313173 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXD8-201ENST00000313173 CDKN1AP38936 164 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXD8-201ENST00000313173 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
HOXD8-201ENST00000313173 PDPNQ86YL7 162 aa21.8■■□□□ 1.08
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HOXD8-201ENST00000313173 VWC2Q2TAL6 325 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXD8-201ENST00000313173 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa21.79■■□□□ 1.08
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HOXD8-201ENST00000313173 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa21.78■■□□□ 1.08
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HOXD8-201ENST00000313173 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa21.78■■□□□ 1.08
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HOXD8-201ENST00000313173 C22orf46C9J442 243 aa21.78■■□□□ 1.08
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HOXD8-201ENST00000313173 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD8-201ENST00000313173 A0A1W2PPE2 198 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD8-201ENST00000313173 A0A1W2PR64 198 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD8-201ENST00000313173 A0A1W2PRV1 198 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD8-201ENST00000313173 IGLV1-47P01700 117 aa21.77■■□□□ 1.08
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HOXD8-201ENST00000313173 HLA-DRB5Q30154 266 aa21.77■■□□□ 1.08
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HOXD8-201ENST00000313173 F12P00748 615 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
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HOXD8-201ENST00000313173 OR4C13Q8NGP0 309 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXD8-201ENST00000313173 KBTBD11O94819 623 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXD8-201ENST00000313173 H2AFB1P0C5Y9 115 aa21.76■■□□□ 1.07
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HOXD8-201ENST00000313173 CHD6Q8TD26 2715 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXD8-201ENST00000313173 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
HOXD8-201ENST00000313173 TLE4Q04727 773 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD8-201ENST00000313173 C10orf91Q5T1B1 145 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD8-201ENST00000313173 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
HOXD8-201ENST00000313173 FKBP11Q9NYL4 201 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD8-201ENST00000313173 ONECUT1Q9UBC0 465 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD8-201ENST00000313173 PRELID1Q9Y255 219 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD8-201ENST00000313173 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXD8-201ENST00000313173 BTBD17A6NE02 478 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXD8-201ENST00000313173 TSPAN4O14817 238 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXD8-201ENST00000313173 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
HOXD8-201ENST00000313173 MC5RP33032 325 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXD8-201ENST00000313173 SPSB3Q6PJ21 355 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXD8-201ENST00000313173 SCRT1Q9BWW7 348 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXD8-201ENST00000313173 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
HOXD8-201ENST00000313173 RRHO14718 337 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXD8-201ENST00000313173 MYOD1P15172 320 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXD8-201ENST00000313173 FGF7P21781 194 aa21.74■■□□□ 1.07
HOXD8-201ENST00000313173 EFNA4P52798 201 aa21.74■■□□□ 1.07
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