RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 OR2K2Q8NGT1 345 aa16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-201ENST00000250495 MCFD2Q8NI22 146 aa16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-201ENST00000250495 SPATA25Q9BR10 227 aa16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-201ENST00000250495 TUBA4BQ9H853 241 aa16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-201ENST00000250495 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
NEDD8-201ENST00000250495 PRH1P02810 166 aa16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 GNG2P59768 71 aa16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 NECAP1Q8NC96 275 aa16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 VSTM2AQ8TAG5 236 aa16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 TGFBR1P36897 503 aa16■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 MECP2P51608 486 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 RPL30P62888 115 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
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NEDD8-201ENST00000250495 HAGHQ16775 308 aa16■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa16■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 DAPK2Q9UIK4 370 aa16■□□□□ 0.15
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NEDD8-201ENST00000250495 IGLV2-14P01704 120 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 OR2B11Q5JQS5 317 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 MFSD4AQ8N468 514 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 OR4S2Q8NH73 311 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 OR2A7Q96R45 310 aa15.99■□□□□ 0.15
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NEDD8-201ENST00000250495 ANXA10Q9UJ72 324 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa15.99■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa15.98■□□□□ 0.15
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NEDD8-201ENST00000250495 IFNA6P05013 189 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 IGKV1-13P0DP09 117 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 SPATA2Q9UM82 520 aa15.98■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 OR2J3O76001 311 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 MAS1LP35410 378 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 C15orf32Q32M92 178 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 C10orf55Q5SWW7 151 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 SFXN4Q6P4A7 337 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF66Q6ZN08 573 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 LAX1Q8IWV1 398 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa15.97■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 HMX3A6NHT5 357 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 SSX5O60225 188 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 KBTBD11O94819 623 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 HRASP01112 189 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 S100A5P33763 92 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 ZFAND6Q6FIF0 208 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 LGALS14Q8TCE9 139 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 RNF167Q9H6Y7 350 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 RHBDL2Q9NX52 303 aa15.96■□□□□ 0.15
NEDD8-201ENST00000250495 TENM2Q9NT68 2774 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 NPIPB5A8MRT5 1133 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 TEX22C9J3V5 150 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 GGCTO75223 188 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 ETV6P41212 452 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 RORCP51449 518 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 ARPC4P59998 168 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 DYNLRB2Q8TF09 96 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 AIFM2Q9BRQ8 373 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 SLC2A9Q9NRM0 540 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 SLC2A8Q9NY64 477 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 TAS2R8Q9NYW2 309 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 FBXL7Q9UJT9 491 aa15.95■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 TPPPO94811 219 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 DHFRP00374 187 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 SDC2P34741 201 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 KIR2DS2P43631 304 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 SCAND1P57086 179 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 CD81P60033 236 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 DEFB114Q30KQ6 69 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 SLC25A46Q96AG3 418 aa15.94■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF785A8K8V0 405 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 PPP5D1E7EU14 171 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 CRYGCP07315 174 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF735P0CB33 412 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 RPS19P39019 145 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 BRWD1-AS2P59051 145 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 MSMO1Q15800 293 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 ZBTB34Q8NCN2 500 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 BEST4Q8NFU0 473 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 NEURL2Q9BR09 285 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 DMRT1Q9Y5R6 373 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 ETV7Q9Y603 341 aa15.93■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 TRAV18A0A075B6X5 111 aa15.92■□□□□ 0.14
NEDD8-201ENST00000250495 LCE6AA0A183 80 aa15.92■□□□□ 0.14
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