RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-209ENST00000607882 CA11O75493 328 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-209ENST00000607882 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-209ENST00000607882 STAG3L2P0CL84 134 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-209ENST00000607882 FXYD4P59646 89 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-209ENST00000607882 GNB2P62879 340 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-209ENST00000607882 PEA15Q15121 130 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-209ENST00000607882 CALHM1Q8IU99 346 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-209ENST00000607882 SECTM1Q8WVN6 248 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-209ENST00000607882 KIRREL1Q96J84 757 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-209ENST00000607882 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-209ENST00000607882 PARP11Q9NR21 331 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF391Q9UJN7 358 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-209ENST00000607882 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1W2PRD5 423 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1W2PRF3 423 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1W2PRM7 423 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 JTBO76095 146 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 NRASP01111 189 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 WNT2P09544 360 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 GABRA2P47869 451 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 COMPP49747 757 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 IL36RNQ9UBH0 155 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 OR5AC1P0C628 307 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 DUSP1P28562 367 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 ERVFRD-1P60508 538 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF616Q08AN1 781 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 BRD3OSQ6XYD6 125 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 RNF2Q99496 336 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 TNFRSF19Q9NS68 423 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 CLN8Q9UBY8 286 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 AK3Q9UIJ7 227 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 OOEPA6NGQ2 149 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 COLCA2A8K830 154 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 GATA4P43694 442 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 FHITP49789 147 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 NHLH2Q02577 135 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 RSU1Q15404 277 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 MIDNQ504T8 468 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 PHLDA2Q53GA4 152 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 C1orf87Q8N0U7 546 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNRF1Q8ND25 227 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 PCGF1Q9BSM1 259 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 RTL8AQ9BWD3 113 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 OR14J1Q9UGF5 321 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 METRNQ9UJH8 293 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1B0GW15 77 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 MBPP02686 304 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 PAX6P26367 422 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 ECI1P42126 302 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 ABCA11PQ4W5N1 156 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 BOD1L2Q8IYS8 172 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 CLCC1Q96S66 551 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 RGCCQ9H4X1 137 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 DVL1O14640 695 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 TSPAN15O95858 294 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 CDPF1Q6NVV7 123 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 LYZL2Q7Z4W2 148 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC54Q8NEL0 328 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 CSTL1Q9H114 145 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 CACFD1Q9UGQ2 172 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF728P0DKX0 622 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 PDCD1Q15116 288 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 PIGYQ3MUY2 71 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 UBAC2Q8NBM4 344 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 C20orf24Q9BUV8 137 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 RPS10P5Q9NQ39 176 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 SMCO4Q9NRQ5 59 aa10.31□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1B0GV50 99 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 ARF6P62330 175 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 CEACAM21Q3KPI0 293 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF841Q6ZN19 808 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 DMBX1Q8NFW5 382 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 OR8B3Q8NGG8 313 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 SLAMF9Q96A28 289 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 OR8B2Q96RD0 313 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 OR51I2Q9H344 312 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 NAA60Q9H7X0 242 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 NECAP2Q9NVZ3 263 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 MPC1Q9Y5U8 109 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM187Q14656 261 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGEF1-209ENST00000607882 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.1 ms