RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588551.5

POP4-208, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, human

TSL 3

Gene POP4, Length 789 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POP4-208	ENST00000588551	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		10.81	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		10.81	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	KLK15	Q9H2R5	256 aa		10.81	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		10.81	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		10.8	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		10.8	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	SOX15	O60248	233 aa		10.8	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	IGLV1-40	P01703	118 aa		10.8	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	ELANE	P08246	267 aa		10.8	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	TBP	P20226	339 aa		10.8	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	PSMB8	P28062	276 aa		10.8	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	UCP3	P55916	312 aa		10.8	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	TAS2R19	P59542	299 aa		10.8	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	FXYD3	Q14802	87 aa		10.8	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	PRSS8	Q16651	343 aa		10.8	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		10.8	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		10.8	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	CCDC190	Q86UF4	302 aa		10.8	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		10.8	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	OR4S2	Q8NH73	311 aa		10.8	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		10.8	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	ZFP57	Q9NU63	452 aa		10.8	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551		V9GYH0	126 aa		10.8	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	GPR31	O00270	319 aa		10.79	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	10.79	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	RAB3D	O95716	219 aa		10.79	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	IFNA6	P05013	189 aa		10.79	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	KIR2DS2	P43631	304 aa		10.79	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		10.79	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		10.79	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	LFNG	Q8NES3	379 aa		10.79	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	OR51H1	Q8NH63	302 aa		10.79	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	ARPC1A	Q92747	370 aa		10.79	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	BORCS5	Q969J3	196 aa		10.79	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		10.79	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	R3HDM4	Q96D70	268 aa		10.79	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		10.78	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	CNIH1	O95406	144 aa		10.78	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	RLN1	P04808	185 aa		10.78	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	S100A5	P33763	92 aa		10.78	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	GNB1	P62873	340 aa		10.78	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	DEFA6	Q01524	100 aa		10.78	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	CATR1	Q13166	79 aa		10.78	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	ZNF79	Q15937	498 aa		10.78	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	ZNF585B	Q52M93	769 aa		10.78	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		10.78	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		10.78	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		10.78	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		10.78	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		10.78	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	TERB2	Q8NHR7	220 aa		10.78	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		10.78	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	RHOV	Q96L33	236 aa		10.78	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
POP4-208	ENST00000588551	OR2A4	O95047	310 aa		10.77	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	HPRT1	P00492	218 aa		10.77	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	HRAS	P01112	189 aa		10.77	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	F2R	P25116	425 aa		10.77	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	ETV6	P41212	452 aa		10.77	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	POU2AF1	Q16633	256 aa		10.77	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	ECSCR	Q19T08	205 aa		10.77	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		10.77	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		10.77	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		10.77	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		10.77	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		10.77	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		10.77	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		10.77	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		10.77	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	OR2A7	Q96R45	310 aa		10.77	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	OR4F4	Q96R69	305 aa		10.77	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		10.77	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	NOTCH1	P46531	2555 aa		10.76	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551		A0A1W2PN81	502 aa		10.76	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551		A6NHS1	94 aa		10.76	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	MSGN1	A6NI15	193 aa		10.76	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	S1PR2	O95136	353 aa		10.76	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	AKAIN1	P0CW23	69 aa		10.76	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	PI3	P19957	117 aa		10.76	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	10.76	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	CHRNA7	P36544	502 aa		10.76	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	RAB9A	P51151	201 aa		10.76	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	TAS2R31	P59538	309 aa		10.76	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	MEF2D	Q14814	521 aa		10.76	□□□□□ -0.69
POP4-208	ENST00000588551	PYDC2	Q56P42	97 aa		10.76	□□□□□ -0.69

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