RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578334.5

TSPOAP1-AS1-202, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 956 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LCN12Q6JVE5 192 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KCTD9Q7L273 389 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GTSCR1Q86UQ5 136 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AKIP1Q9NQ31 210 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TENM2Q9NT68 2774 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FAM223BA6NKX1 122 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR2A4O95047 310 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR2B11Q5JQS5 317 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HACD4Q5VWC8 232 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FAM223AQ8IWN6 122 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SPIN2AQ99865 258 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR2W1Q9Y3N9 320 aa21.48■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NOTOA8MTQ0 251 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TUSC2O75896 110 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CTXN2P0C2S0 81 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CD36P16671 472 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GABARAPL2P60520 117 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ATP5G2Q06055 141 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C10orf55Q5SWW7 151 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MMD2Q8IY49 270 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 Q8N402 240 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PEMTQ9UBM1 199 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PSMB9P28065 219 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNF45Q02386 682 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TUBA4BQ9H853 241 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RAB26Q9ULW5 256 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 STARD9Q9P2P6 4700 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TMEM235A6NFC5 223 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HLA-DQB1P01920 261 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RPL30P62888 115 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZFAND6Q6FIF0 208 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ISOC1Q96CN7 298 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SPATA25Q9BR10 227 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DCSTAMPQ9H295 470 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DAPK2Q9UIK4 370 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IZUMO1RA6ND01 250 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BMPR1BO00238 502 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SLC22A5O76082 557 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GNG2P59768 71 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 UBE2UQ5VVX9 321 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa21.43■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IGKV1-13P0DP09 117 aa21.43■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HAGHQ16775 308 aa21.43■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CNIH2Q6PI25 160 aa21.43■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TTC9CQ8N5M4 171 aa21.43■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SCGNO76038 276 aa21.42■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IGLV2-14P01704 120 aa21.42■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SLC25A42Q86VD7 318 aa21.42■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NECAP1Q8NC96 275 aa21.42■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR4S2Q8NH73 311 aa21.42■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa21.42■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR51E2Q9H255 320 aa21.42■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 EDA2RQ9HAV5 297 aa21.42■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SPATA2Q9UM82 520 aa21.42■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HMX3A6NHT5 357 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AIREO43918 545 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR2J3O76001 311 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TPRA1Q86W33 373 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SPARTQ8N0X7 666 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LGALS14Q8TCE9 139 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ANXA10Q9UJ72 324 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CSMD3Q7Z407 3707 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C15orf32Q32M92 178 aa21.4■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR2K2Q8NGT1 345 aa21.4■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 VSTM2AQ8TAG5 236 aa21.4■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SSR3Q9UNL2 185 aa21.4■■□□□ 1.02
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SSX5O60225 188 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KBTBD11O94819 623 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MECP2P51608 486 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SFXN4Q6P4A7 337 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DYNLRB2Q8TF09 96 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FCGR1BQ92637 280 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR2A7Q96R45 310 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TAS2R8Q9NYW2 309 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DPPA5A6NC42 116 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TEX22C9J3V5 150 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PPP5D1E7EU14 171 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CD81P60033 236 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C19orf35Q6ZS72 473 aa21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms